选择单细胞测序基准数据集的标准通常包括以下几个方面:
1. 数据质量和可靠性 - 低噪声、低错误率,经过严格的质量控制步骤,例如对低质量细胞的有效过滤。
2. 代表性 - 涵盖广泛的细胞类型、组织和生理/病理状态,能够代表常见的研究场景和问题。
3. 标注完整性和准确性 - 包含详细且准确的细胞类型、状态、实验条件等标注信息,作为评估分析结果的可靠参考。
4. 样本规模 - 具有足够数量的细胞样本,以提供充分的统计效力和反映真实的生物多样性。
5. 技术多样性 - 涵盖不同的单细胞测序技术和平台,以确保分析方法在多种技术产生的数据上具有通用性。
6. 公开可用性和许可 - 可以免费获取,并允许在学术和研究环境中合法使用。
7. 数据格式和兼容性 - 数据格式易于处理和分析,能够与常用的分析工具和软件兼容。
8. 重复性和稳定性 - 不同研究团队在相同数据集上能够获得相似的结果,证明数据的稳定性和可重复性。
9. 生物学相关性 - 与当前热门的生物学问题和研究方向密切相关,具有潜在的应用价值。
10. 社区认可和使用 - 在相关研究领域中被广泛认可和使用,具有一定的影响力。
中国农业大学动物科学技术学院教授孙东晓团队构建了覆盖奶牛59种组织、179万个细胞的多组织单细胞表达图谱,为解析牛重要性状遗传调控机制、推进精准育种及探索人类疾病的牛模型研究提供了重要资源。9月5日,......
厦门大学教授史大林团队基于在西北太平洋副热带流涡区开展的高分辨率观测,定量分析了固氮生物群落的丰度、结构和固氮速率,进而应用广义加性模型刻画的优势固氮蓝藻的生态位特征预测了其在全球海洋的主要分布格局,......
得益于双子叶模式植物拟南芥和单子叶模式植物水稻的遗传学研究,植物发育生物学在过去40年取得了长足发展。植物分生组织(干细胞)的建立与维持机制、重要组织和器官的分化轨迹及其核心调控网络已初步建立。这些基......
近日,中国科学院广州生物医药与健康研究院研究员林达等报道了新开发的单细胞多组学技术——Uni-C。该方法可在一个细胞中同时解析基因组大尺度结构变异(如SV、CNV、ecDNA)、小尺度突变(SNP/I......
记者杨舒从中国农业科学院生物技术研究所获悉,该所作物耐逆性调控与改良创新团队日前联合国内外研究机构,构建了首个水稻的多器官单细胞多组学图谱,系统解析了水稻不同细胞类型的功能及其对复杂性状的调控作用,有......
作为当前生物医学研究的前沿热点领域,单细胞蛋白质组学通过在单细胞层面上探索蛋白质表达模式,精确揭示细胞异质性,为解码生命过程和疾病发生机制提供了独特视角,已成为赋能精准医疗和生物医药创新的关键技术,是......
BeaconDiscovery™单细胞功能表征平台将帮助研究者解锁活体单细胞功能分析的全部潜力。它采用Beacon®的光电定位(OEP)和微流体芯片光技术,使研究人员能够实时探索多模态和动态细胞反应,......
2025年4月26日,由北京市科学技术研究院分析测试研究所(北京市理化分析测试中心)、创新方法研究会科学工具专业委员会、北京理化测试技术有限公司主办,北京市科学技术研究院生物技术与健康研究所、宁波华仪......
喉气管狭窄(LTS)作为临床上棘手的上呼吸道疾病,其典型特征是细胞外基质(ECM)异常沉积导致的气道狭窄。随着COVID-19等公共卫生事件中气管插管应用的增加,医源性LTS的发生率显著上升。尽管手术......
由于无法对蛋白实现扩增,因此在单细胞多组学的研究中,单细胞蛋白质组学是最具挑战的研究,近年来已取得突飞猛进的进展。除了质谱仪检测灵敏度的提升,在前端取样、预处理和分离方面的巨大进步是重要因素,这和微流......