单细胞测序技术被广泛应用于基础科研和临床研究。单细胞在许多领域都占有一席之地,对于癌症早期的诊断、追踪以及个体化治疗具有重要意义。
初次听说细胞测序技术,又是什么噱头?如果细胞测序就能测一个细胞或几个细胞的话,这有什么意义?特别是对异质性高的肿瘤组织来讲,测一个细胞能代表什么?
无论是蠕虫,蓝鲸,还是人类,自然界所有的多细胞生命都是从单个细胞发育而来开始。这样一个单细胞,鬼斧神工地构建出有机生命体所需的各种组织、器官、系统。每个新细胞在正确的时间,在正确的地方分裂、分化,并与相邻细胞协调精准发挥功能。
多细胞生命的发育过程,是自然界中引人注目的壮举之一。尽管经过数十年的研究,生物学家仍然无法完全理解这一过程。测序首先不是仅仅对一个细胞进行测序,而是说该项技术能对单一细胞的基因组或转录组进行测序,可以理解为单细胞水平上的测序。
在介绍基本原理之前先让我们尝试着回答一下:为什么要进行测序?换个姿势来问就是,单细胞测序技术能解决什么传统方法解决不了的问题?
世界上没有两片相同的叶子,对于多细胞生物来说细胞与细胞之间是存在差异的,很多时候是基因组、转录组上的失之毫厘,功能上的差之千里。
比如在肿瘤组织中,肿块中心的细胞与肿块周围的细胞,原发灶与转移灶的细胞,其基因组与转录组等遗传信息是存在差异的,这也就导致不同肿瘤细胞表现出免疫特性、生长速度、侵袭能力等表型方面的差异,导致对不同抗肿瘤药物的敏感性不同或放疗敏感性的差异。该技术得以实现的原理:将单细胞分离出来,单独构建测序文库,并进行测序。
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