利用抗生素进行筛选,是分子克隆的一个关键步骤。日前,南开大学的研究者们以CRISPR/Cas技术为基础,开发了一个重复利用抗生素抗性的简单筛选方法,这一方法非常适用于多步骤的基因工程改造。对于一个分子生物学实验室来说,抗生素抗性基因几乎是不可或缺的。虽然这些基因是鉴定正确克隆的有力工具,但抗生素抗性基因有数量限制,束缚了人们进行复杂基因工程改造的能力。
南开大学生命科学学院的陈凌懿教授在四月份的BioTechniques杂志上发表文章,描述了一个在几轮克隆中重复进行一种抗生素筛选的简单方案。这一技术将为哺乳动物细胞的基因工程改造带来可喜改变。去除抗生素抗性基因,就可以在进一步基因改造时,继续使用同一种抗生素进行筛选。为此,研究人员采用了被称为CRISPR/Cas的新技术。CRISPR/Cas是一个新兴的基因组编辑工具,能够定向切割特定的DNA片段。
陈教授的研究团队通过软件搜索了针对嘌呤霉素抗性基因puro的引导序列,引导序列负责将CRISPR/Cas机器引导到正确的靶点。他们选择了脱靶效应最小的引导序列,并将其克隆到相应的质粒上与Cas9共表达。
研究人员通过CRISPR/Cas系统,在小鼠胚胎干细胞系中破坏了嘌呤霉素抗性基因,并使用PCR和测序验证了puro基因中的缺失。随后,他们用含有puro基因的载体转染这些细胞,恢复了进行嘌呤霉素抗性筛选的能力。
在此之前,人们一般用Cre-loxP或Flp-FRT重组系统去除抗生素筛选基因。但陈教授认为,CRISPR/Cas系统更加实用。“我们的方案最适合于多步骤的基因组工程改造。尤其是当抗生素抗性基因两侧没有预先设计LoxP或FRT位点时。”
尽管CRISPR/Cas的应用近来已经发表了不少文章,陈教授认为这还只是一个开端。“研究显示,CRISPR/Cas技术是一个有力的基因组编辑工具,可以完成常规或条件性的基因敲除和敲入。可以想见,最终人们将能利用CRISPR/Cas技术在患者体内校正基因缺陷和突变。”
陈凌懿教授简介:
所属部门:遗传学和细胞生物学系
招生专业:细胞生物学
研究方向:小鼠胚胎早期发育中转录编程的调控机制;胚胎干细胞的发育多能性的分子机制;建立诱导
1999 北京大学 学士
2004 美国西北大学 博士
2005--2008 美国哈佛大学 博士后
2008-- 南开大学生命科学学院 教授、博导
近日,西安交通大学第一附属医院感染科教授何英利团队在《医学微生物学杂志》发表研究成果,明确抗生素暴露会通过破坏肠道菌群平衡、诱发继发性肝损伤,进而加重慢加急性肝衰竭(ACLF)患者病情并降低其生存率。......
近日,湖北省农业科学院果树茶叶研究所联合华中农业大学园艺林学学院,在柑橘风味品质形成机制研究中取得新进展。研究团队鉴定出一个可同时调控蔗糖积累与柠檬酸代谢的关键基因模块,为柑橘风味品质定向改良提供了新......
抗生素耐药性已成为威胁全球公共卫生的重大挑战。据估计,每年有数百万人死于耐药菌感染。在这一背景下,国家现代农业技术体系四川生猪创新团队粪污处理技术研究岗位、四川农业大学动物科技学院教授白林团队在环境耐......
一项研究显示,干旱可能会增加土壤中天然抗生素的浓度,促进耐抗生素微生物生长。利用116个国家的临床数据,研究人员还报告了干旱程度和医院中抗生素耐药性平均发生率之间的关联,提出了气候变化对公共健康影响的......
近日,中国农业科学院茶叶研究所茶树遗传育种创新团队利用多基因激活系统,在茶树根系中实现了茶氨酸生物合成的2个关键基因同步激活,显著提高了茶氨酸含量。相关结果发表在《园艺研究》(Horticulture......
仔猪断奶通常伴随肠道健康失衡和严重的腹泻问题。养殖场为应对这一挑战,大多依赖抗生素等进行被动防治,但这一方案面临药物残留与耐药性的双重困局,且抗生素会威胁食品安全与生态平衡,甚至陷入“用药—耐药—加量......
安徽师范大学教师李想首次从细胞层面系统揭示了低浓度抗生素如何影响微生物氮循环并促进温室气体氧化亚氮的排放,为认识抗生素污染的气候效应提供了新的科学证据。研究成果发表于《环境科学与技术》。环境浓度四环素......
近日,一项发表于《分子精神病学》的研究发现,单个基因GRIN2A可直接导致精神疾病。而此前的研究认为,精神疾病是由许多基因共同作用所致。根据世界卫生组织(WHO)数据,2021年全球每7人中就有1人患......
近日,西安交通大学第一附属医院教授刘冰团队在《先进科学》封面发表了研究论文。该研究从细菌的天敌“噬菌体”入手,基于噬菌体天然的抑菌机制,创新性地开发出一类可精准靶向细菌类核相关蛋白HU的小分子候选药物......
三维基因组互作与表观遗传修饰是基因表达调控的重要因素,其动态变化与细胞生长发育及癌症等疾病的发生发展密切相关。解析染色质在活细胞内的时空动态,是理解基因调控机制的重要科学问题。现有基于CRISPR-C......