一个跨国团队首次对选择性剪切进行了大规模的系统性研究。他们最近在Cell杂志上发表文章指出,同一个基因编码的蛋白质异构体常常承担着截然不同的作用,不论它们结构上有多么相似。南方医科大学第一附属医院(南方医院)的Xinping Yang博士是这篇文章的共同第一作者。
这一发现将显著影响我们的生物学认识以及未来的研究方向。研究人员认为,我们有必要分别研究各个蛋白质异构体的正常功能,阐明它们在疾病中扮演的不同角色。“过去在研究癌症相关蛋白的时候,我们往往选择细胞、组织或器官中最普遍的异构体,”这篇文章的资深作者,Dana-Farber癌症研究所的David E. Hill博士说。“其实不那么普遍的蛋白质异构体也可能与疾病有关,并且有望成为新的治疗靶标。”
选择性剪切是一个基因生成多个蛋白质异构体的重要途径。研究人员通过自己开发的ORF-Seq技术,鉴定和克隆了大量的选择性剪切产物(开放阅读框ORF)。他们由此获得了506个基因的1423个蛋白质异构体,并对其中1,035个蛋白质异构体进行深入研究。他们将这些异构体与15,000个人类蛋白配对,分析它们的互作情况。
“来自同一个基因的蛋白质异构体,互作对象往往差异很大,”文章的另一位第一作者Gloria Sheynkman博士说。“这些异构体在细胞中的作用可能大不相同。”在绝大多数情况下,异构体只分享不到一半的互作对象。互作对象完全不同的异构体占到总数的16%。
“剪切异构体的互作对象存在显著差异,说明仅在基因水平上鉴定疾病通路是不够的,我们的研究应当更加深入,”文章的另一位资深作者,加州大学的Lilia Iakoucheva说。“更为详细的蛋白质互作网络对于理解人类疾病有很重要的意义。”
2014年08月,研究者们开发了一个可以口服的小分子药物,这种药物能够改变特定mRNA的剪切,在运动神经元中恢复关键蛋白的合成。运动神经元负责将神经系统的信号传递给肌肉纤维。在脊髓性肌萎缩症(SMA)患者中,运动神经元缺乏生存所需的一种蛋白,结果神经元逐步死亡而患者肌肉日渐萎缩。研究人员用自己的药物对SMA小鼠模型进行治疗,成功改善了小鼠的肌肉量、运动机能和生存情况。
2014年12月Cell杂志发表的一项研究表明,微小的基因片段microexon会影响神经系统中的蛋白互作。神经元通过选择性剪切使用microexon,microexon拼接到mRNA上生成神经系统必需的一些蛋白。这一过程如果出现异常,神经系统的功能就会受到重要影响。这一发现位让人们开辟了研究自闭症病因的新途径。
2015年8月多伦多大学的研究人员在Science杂志上发表文章指出,我们人类成为地球上最聪明的动物得益于一个关键性分子事件。在脊椎动物中,大脑的大小和复杂程度存在着很大的差异。举例来说,人类和青蛙已经独立演化了三亿五千万年,其大脑功能已经有天壤之别。那么这巨大的差距是如何形成的呢?研究显示,PTBP1蛋白的选择性剪切控制着神经元的生成,帮助哺乳动物进化出更大更复杂的大脑。
近日,中国医学科学院北京协和医院赵海涛团队与中国医学科学院蛋白质组研究中心/基础医学研究所质谱中心孙伟团队携手攻关,在胆管癌治疗领域取得重大突破。他们的研究首次将尿液蛋白质组学与单细胞、空间转录组学相......
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