发布时间:2014-05-14 14:48 原文链接: 合成生物学:文化鸿沟上的拉锯战

  尽管两个阵营之间的文化差异仍然很大,但有迹象表明,其间的桥梁已经开始搭建。

  合成生物学正在逐步从专注于手工制作的生物学转向大规模集体创建标准化部件,从而产生了ZL存在形式之争。

  加拿大一位未来主义者Andrew Hessel有一个关于如何治疗乳腺癌的非正统想法。他问道:如果志愿研究人员都共同合作研究,是否可以与拥资数十亿美元的制药公司相匹敌呢?

  他的Pink Army合作社正试图通过引入来自合成生物学的开源工具做到这一点。合成生物学是一个新兴领域,使用工程原理和模块方法设计生物制品。自从2009年该合作社成立,近600人已经进行了投资。加入的成本是多少呢?仅20美元。

  Hessel的计划依赖于那些可以结合到癌症治疗创新方式中的免费软件和生物部分,不需要大量的前期投资或者ZL权保护。他戏称自己为“合成生物学开源的催化剂”。

  这种开放性是合成生物学的未来愿景之一。另一种可能性则是大型制药公司,例如辉瑞、默克和罗氏等公司,其高效药物研究的收入会投入到封闭的大规模研究项目中。这样的企业对新药物和其他医学进步的追求在很大程度上依赖于保护ZL和限制性的许可协议。

  在该行业占主导地位的美国华盛顿生物技术工业组织(BIO)表示,知识产权的严格限制对于鼓励有前途的医学发展是必要的。

  合成生物学家如何解决开放资源和ZL保护之间的矛盾将决定该领域能否实现其雄心勃勃的目标,即通过精密工程来转化医药、农业、能源、环境修复和其他产业。“这不仅仅是投资回报的问题。”美国马萨诸塞州非营利组织生物砖基金会法律项目主管Linda Kahl表示。生物砖基金会倡导可实现公共利益的生物工程。“它不仅仅是商业应用,它也在为世界做好事。”

  两种文化

  2003年,爱思唯尔的斯高帕斯数据库中仅有3篇经过同行评议的文章使用了“合成生物学”这个术语;到2013年,相关论文则有800篇。去年,该领域实现了一项重要进展。利用加利福尼亚大学伯克利分校生物化学工程师Jay Keasling的一项发现,总部位于法国巴黎的制药公司赛诺菲开始大规模生产抗疟药物青蒿素的部分合成形式。另外,更多的进步正在酝酿中,例如,太平洋西北国家实验室的研究人员正在制造合成真菌酶,可将损伤植物中的糖转化成燃料和其他在工业中有用的化学物质。

  从一开始,该领域就是多种知识产权的混合体。一方面,软件工程师带来了开放性的工作方式,他们拥有公共注册中心或者仅有轻微限制的许可协议。而另一方面,分子生物学和生物技术则带来了基因、分子与技术过程ZL的做法。例如,1997年到1999年期间发表于《自然—生物技术》上的一半论文都与ZL相连。“他们有着不同的观点、目标,在某些情况下还有着不同的预期。”堪萨斯大学法学教授Andrew Torrance关注着合成生物学领域。

  哪种知识产权文化将主导合成生物学尚不明确。去年6月,在分子病理学会与Myriad Genetics公司的对峙案件中,美国最高法院裁决,基因和基因标记等“自然产物”没有资格获得ZL。Torrance称,从本质上看,合成生物学产生了无法自然产生的DNA,因此法院的裁决明显允许人造DNA获得ZL。

  因此,至少在美国,合成生物学测序和技术可以申请ZL。但是研究人员、企业、律师和伦理学家正在积极讨论着该行为的道德与伦理问题。

  ZL支持者称,保护知识产权对刺激创新是必要的。加州合成基因组公司创始人和首席执行官Craig Venter称赞法院对自然产生和人造DNA片段进行了区分。“这些人造基因结构已经被用于制作新疫苗、生物燃料和营养产品。”他说,“保护知识产权的能力是健康的科学和生物技术产业的必要组成部分。”

  但开源倡导者认为,ZL会压制创新。该观点普遍存在与创业公司、非营利组织、研究生项目和广受欢迎的年度基因工程机械(iGEM)竞赛中。这些研究人员称,如果企业和大学为关键的合成生物学工具及构建模块申请ZL,它们会对其他人的使用收取高额费用,基于这些发现的新产品创造的成本就会十分高昂,尤其对于那些拥有很少资源的初创企业和组织来说更是如此。

  多元生态

  全民免费的合成生物学运动正在通过组建类似于开源软件注册的公共注册中心推进其目标。该领域最古老、规模最大的标准生物学组件iGEM注册机构就拥有由进入iGEM竞赛的团队所提交的样本。Torrance表示,通过在用于公共获取的存储库中建立一个关键组件,共享倡导者所建立的资源可以使未来的创新者依靠它开发合成生物学的构建块(被称为“生物砖”)。

  生物砖基金会已经开发了一种法律工具,被称为生物砖公共协议:基于开放资源获取标准化生物部分的合同。贡献者同意不维护任何现有的或未来的知识产权,从而获得用户的承诺,用户会给予开发人员适当的信用分数,并遵守安全规定。

  支持者称,iGEM注册机构在近些年已经取得了很大改善,并开始向强调质量控制的新集合发展。

  两方的合成生物学家称,该领域很少有人对ZL问题持有极端看法。很多人反而支持“多元生态”的观点,既包括保护知识产权,又包括公众共享协议。如此一来,问题的复杂性就出现了:如果将合成生物学的构建块比作乐高积木,在这种情况下,乐高积木是免费的,而由数以百计的乐高积木拼成的复杂火箭飞船则可以申请ZL。

  为了阐述一个健康友好的开源结构对合成生物学家意味着什么,Hessel指出了Linux计算机操作系统——该开源平台十分受欢迎,现在广泛应用于计算机行业。尽管其基本操作系统是免费的,开发人员还是基于它建立了私有企业,就像生物技术公司可以将免费的合成生物学构建模块纳入更为复杂的ZL系统中。

  尽管生物砖和其他开源系统已经显示出了其在研究项目中的潜力,支持者表示,现在预测它们多大程度上会被纳入商业研究与发展还为时过早。银杏生物工作室联合创始人Tom Knight是麻省理工学院的电脑工程师,他被称为“合成生物学之父”。他表示,该领域正在逐步从专注于手工制作的生物学转向大规模集体创建标准化部件。如果这种转变得以持续,那么企业将会希望在没有复杂ZL协议的情况下实现小部件互换。Knight称,ZL将不会完全消失,但是在工业背景下其作用有限。

  今年3月,Hessel在2014年制药企业伦敦峰会上与制药企业高管和顾问讲述了Pink Army合作社的癌症治疗工作。6月,BIO邀请他参与BIO国际大会中关于新型生物技术趋势的讨论会。尽管两个阵营之间的文化差异仍然很大,但有迹象表明,其间的桥梁已经开始搭建。

相关文章

在“白色荒漠”打响新“绿色战役”

胡赞民(右二)、范成明(左一)等正在查看油菜籽生长情况。遗传发育所供图5月的新疆和田,大地初披新绿。中国科学院遗传与发育生物学研究所(以下简称遗传发育所)高级工程师唐丁与博士生尤常清、博士后吴雪丹播完......

2025年广东省生物学名师工作室联合研修班举行

8月22日至23日,《知行岭南・生命课堂进阶计划》——2025年广东省生物学名师工作室联合研修班在鼎湖山国家级自然保护区(以下简称鼎湖山保护区)分2批次开展科普课程学习。来自广东省各地生物学名师工作室......

科学家合成第二种可在常温条件下研究的环碳

英国牛津大学的研究人员成功合成了一种新型全碳分子——环[48]碳(C48)。这是继35年前合成的富勒烯(C60)以来,第二种能够在常温条件下进行研究的全碳分子。这一突破可能为新的电子和量子技术带来极其......

我国学者发现植物防御激素水杨酸合成新通路

图种子植物中水杨酸合成的完整通路在国家自然科学基金项目(批准号:32330008、32300255)等资助下,四川大学张跃林团队完整解析了植物中一条全新的水杨酸合成通路“PAL/BSH途径”,并证明该......

谷歌DeepMind推出AlphaGenome:AI破解40亿年DNA密码,开启基因组研究新纪元

基因组,宛如生命的蓝图,藏在我们每一个细胞之中。这套完整的DNA指令集,主导着生命体从外观功能到生长繁殖的几乎每一个方面,甚至是对疾病抵御的能力。2003年,人类基因组测序完成,让人类首次窥见了DNA......

关于专利局海口代办处专利费用收缴账户变更的公告(第631号)

国家知识产权局公告第六三一号国家知识产权局专利局海口代办处专利费用收缴账户变更。变更后信息如下:户  名:国家知识产权局专利局海口代办处开户银行:中国工商银行股份有限公司海口滨江支......

形成长效机制我国专利转化运用方面再出实招

国家知识产权局21日公布关于纵深推进专利转化运用专项行动加快形成长效机制的通知,旨在推动新一批高价值专利实现产业化,实现高校和科研机构专利产业化率明显提高。同时,加快构建专利转化运用生态,形成一系列促......

华中农业大学一项专利成功转化1210万元

5月19日,华中农业大学生物医学与健康学院、生命科学技术学院举行“改性ZnS纳米颗粒在制备治疗缺血性脑卒中药物中的应用”专利转让签约仪式及校企合作研讨会。华中农业大学脑健康团队将专利以1210万元的合......

何静委员:促进高校专利转化

“近年来,我国高等学校在科技创新方面取得了显著成就,专利申请与授权数量逐年增加。然而,尽管高校拥有大量专利,真正转化为生产力、应用于实际生产的专利数量却相对较少。”全国政协委员、北京化工大学教授何静指......

生物学领域最大规模AI模型发布

2月19日,美国弧形研究所、美国芯片制造商英伟达公司和美国斯坦福大学等机构的研究人员共同开发的人工智能(AI)生物学模型Evo2正式发布。目前,该模型已开放给全球科研人员,他们可通过网页使用该模型,还......