基因芯片技术突出特点是集成化、微型化、自动化，代表了未来分子诊断的发展趋势。其优点有以下几个方面：
一是高度的灵敏性和准确性；
二是快速简便；
三是可同时检测多种疾病。
因此已广泛应用于DNA序列测定、基因表达谱分析、基因组研究、基因突变检测及多态性分析、疾病的临床诊断和预测、药物研究与开发以及法医鉴定、工农业、食品与环境卫生监督等领域。
