发布时间:2019-04-21 15:25 原文链接: 基因工程菌-海洋线虫系统的生物测定

实验概要

本实验在成功构建了表达Cip蛋白的重组酿酒酵母的基础上,对其应用于Panagrellus redivivus线虫的生物测定进行了探讨,并与重组大肠杆菌比对。

主要试剂

1. 主要试剂

   1) 蛋白胨(Peptone),广州环凯微生物科技有限公司;

   2) 尿嘧啶(Uracil),AMRESCO进口分装,上海生工;

   3) 胆固醇(Cholesterol),AMRESCO进口分装,上海生工;

其他试剂为国产分析纯。

2. 培养基和常用溶液

   1) NGM(Nematode Growth Medium)培养基

NaCl                          3 g

Peptone                        2.5 g

H2O                           to 1 L

如配制固体培养基,还需加入1.7%琼脂粉。高压灭菌50 min后,待培养基冷却至55℃,依次加入下列试剂:

CaCl2(1 mol/L)                1 mL

Uracil(2 mg/mL)               1 mL

Cholesterol(10 mg/mL)          0.5 mL

磷酸钾缓冲液(1 mol/L,pH 6.0) 25 mL

MgSO4(1 mol/L)               1 mL

小心混匀后,倒平板,注意不要引入气泡,NGM平板可在4℃保存数周。配制液体NGM则待完全冷却后,依次加入上述试剂。

   2) M9缓冲液

Na2HPO4                       6 g

KH2PO4                        3 g

NaCl                           5 g

MgSO4·7H2O                   0.25 g

以双蒸水定容至1000 mL,高压灭菌50 min,室温保存。

   3) 0.1%硫柳汞,称取0.1 g硫柳汞溶于100 mL双蒸水中,细菌过滤器过滤除菌,4℃保存。

   4) 1 mol/L CaCl2溶液,称取无水CaCl2 11.1 g,溶于100 mL双蒸水中,高压灭菌20 min,保存于4℃。

   5) 2 mg/mL尿嘧啶(Uracil),准确称取尿嘧啶100 mg溶于50 mL双蒸水中,细菌过滤器过滤除菌,4℃保存。

   6) 10 mg/mL胆固醇(Cholesterol),确称取胆固醇0.5 g溶于50 mL无水乙醇中,4℃保存。

   7) 1 mol/L磷酸钾缓冲液(1 mol/L K2HPO4,1 mol/L KH2PO4,pH 6.0),分别配制2 mol/L K2HPO4及2 mol/L KH2PO4溶液,准确量取12.3 mL K2HPO4溶液与87.7 mL KH2PO4溶液,与80 mL双蒸水充分混匀,测定溶液的pH值,如有必要微调至6.0,以水定容至200 mL,高压灭菌20 min,4℃保存。

   8) 1 mol/L MgSO4溶液,称取MgSO4·7H2O 24.647 g,溶于80 mL双蒸水,定容至100 mL,高压灭菌20 min,保存于4℃。

主要设备

1. 24孔及96孔细胞培养板,美国Corning公司;

2. XSZ-D2型倒置显微镜,重庆光学仪器厂;

3. Leitz020-435.025光学显微镜,德国ERNST LEITZ WETZLAR GMBH;

4. 40倍双目解剖镜,日本Nikon;

5. 细菌过滤器(0.2 µm孔径),美国Pall公司。

实验材料

1. 大肠杆菌Escherichia coli OP50;

2. 酿酒酵母Saccharomyces cerevisiae INVSc1;

3. 重组酿酒酵母INVSc1/pYES2.1/V5-His-TOPO-cipA、INVSc1/pYES2.1/V5-His-TOPO-cipB;

4. 海洋线虫Panagrellus redivivus

实验步骤

1. 菌株的培养

   1)  大肠杆菌的培养

在LB(50 µg/mL Car)培养基中培养基因工程菌BL21(DE3)/pET-15b-cipA、BL21(DE3)/pET-15b-cipB、BL21(DE3)/pET-15b至对数生长期,将菌液均分为两份,一份中加入IPTG溶液(终浓度为1 mmol/L),另一份不加,37℃继续培养8~12 h。

   2)  酿酒酵母的培养

对携带有cipAcipB基因的重组酿酒酵母,挑取直径2 mm左右的单菌落,挑取SC-U(2%葡萄糖)平板上重组酵母单菌落,接种于15 mL SC-U(2%葡萄糖)中,250 r/min、30℃培养过夜;测定菌液OD600值,分别吸取2 mL菌液,离心(1500 g,4℃,5 min),将细胞沉淀以无菌SC-U(2%半乳糖)培养基洗涤一次,分别重悬于10 mL无菌SC-U(2%半乳糖)和10 mL无菌SC-U(2%葡萄糖)中,250 r/min、30℃分别培养18 h、12 h;

对酿酒酵母INVSc1,于YPD液体培养基中培养12 h即可。

2. 线虫的制备

   1) 线虫的培养

      A. 按照2%的接种量,接种E. coli OP50 100 µL于5 mL LB培养基中,37℃,200 r/min振荡培养24 h;

      B. 吸取培养OP50菌液0.1 mL,滴加至NGM平板上,无菌刮棒平铺后,37℃倒置培养24 h;

      C.  将线虫种接入培养有OP50菌株的NGM平板上,置于25℃。

   2) 无菌J1线虫的获得

      A. 查看NGM平板上雌虫的形成情况和怀卵情况,一般培养42 h后大部分雌虫都有发育成熟的卵;

      B. 超净工作台上,收集怀卵雌虫,用无菌针头将怀卵雌虫挑至装有无菌M9缓冲液的培养皿中;

      C. 以无菌M9缓冲液清洗收集的线虫三次:吸取M9缓冲液到培养皿中,混合均匀,使线虫悬浮并与液体充分接触,待线虫自然沉降后,用移液器将缓冲液吸走;

      D.  加入0.1%硫柳汞,使怀卵雌虫充分悬浮,置于25℃,50~70 r/min体表消毒半小时;

      E.  挑10条左右上述处理后的怀卵雌虫,置于培养皿中,加入200 µL无菌M9缓冲液;

      F. 解剖镜下,用无菌针头将虫体刺破,待卵自然漂浮离体后,将虫体移开;

      G. 选取漂浮的单颗分离的卵,用无菌200 µL吸头吸至加有无菌M9缓冲液的24孔细胞培养板上,每孔100~150颗卵;

      H. 以无菌M9缓冲液清洗收集的卵2次,清洗后,待卵自然沉降,解剖镜下吸走液体,小心不要吸走卵;

      I. 加入400 µL无菌NGM液体培养基,置于25℃,50~70 r/min缓摇过夜,观察是否有细菌生长,以及卵的恢复情况;

      J. 2~3天后,如果没有杂菌生长,由卵所孵化出的J1幼虫即可视为无菌幼虫,可以用于后续的实验操作。

3. 重组大肠杆菌-海洋线虫培养系统的建立

以无菌Panagrellus redivivus J1幼虫为目标线虫,按照以下方法建立液体测定系统:

   1)  生物测定前,测定各待测菌液的OD600值,如有必要,以无菌LB(50 µg/mL Car)液体稀释各菌液至相等的OD600值,待用;

   2) 在24孔细胞培养板上,分别加入各待测菌液(包括诱导和未诱导的),每孔250 µL,以无菌LB(50 µg/mL Car)为空白对照,每个处理设三个重复;

   3) 每孔中加入15条J1线虫,以parafilm膜封口;

   4) 25℃下,将培养板置于水平摇床上缓摇培养(70 r/min),每24 h检查线虫生长、繁殖及死亡情况。

4. 重组酿酒酵母—海洋线虫培养系统的建立

以无菌Panagrellus redivivus J1幼虫为目标线虫,按照以下方法建立液体测定系统:

   1) 对各培养菌液,离心获得细胞沉淀,以无菌NGM洗涤沉淀一次,然后重悬于无菌NGM液体中。以无菌NGM培养基为空白对照,调整细胞悬浮液的OD600值,使之均为2.5;

   2)  在24孔细胞培养板上,分别加入培养的酵母细胞悬液(包括诱导和未诱导的)及对照悬浮液,每孔250 µL,以无菌NGM液体为空白对照,每个处理设三个重复;

   3)  每孔中加入10~15条J1线虫,以parafilm膜封口;

   4) 25℃下,将培养板置于水平摇床上缓摇培养(70 r/min),每24 h检查线虫生长、繁殖及死亡情况。

5. 镜检与数据分析

倒置显微镜及体视镜下,检查幼虫生长发育情况、雌雄虫形成、雌虫怀卵量、繁殖情况、各种虫态的死亡情况以及第二代线虫的形成情况。

数据以百分数形式表示,经平方根反正弦转化后,以SPSS 11.5 软件进行统计分析。本文中,除明确说明外,生物测定的平均数据以“平均数±标准误(SE)”表示,方差分析采用邓肯氏新复差检验法(Duncan’s Multiple Ranger Test,DMRT)。


相关文章

酿酒酵母胞内代谢通量调控机制方面获进展

细胞内的代谢通量受胞内基因表达、转录调控、蛋白修饰、别构效应等调控体系共同作用。然而,目前关于细胞内代谢通量的详细调控机制存在较多未知,例如代谢通量的变化到底在多大程度上依赖基因表达以及有多大程度通过......

天津工生所酿酒酵母合成甲基酮研究获进展

甲基酮是一类脂肪酸衍生物,可用作信息素类杀虫剂,也被用于香精、香料、化学合成中间体以及生物燃料调和剂。由于植物提取效率低,甲基酮主要通过烃类的化学氧化合成。代谢工程和合成生物学的发展,为利用微生物平台......

欧盟延长一种酿酒酵母作为奶羊饲料添加剂的授权期限

据欧盟官方公报消息,2019年5月28日,欧盟委员会发布法规(EU)2019/857,批准延长酿酒酵母CNCMI-1077作为奶山羊和奶绵羊饲料添加剂的授权日期。酿酒酵母CNCMI-1077作为饲料添......

微生物所揭示驯养酵母菌的起源和适应性进化机制

酿酒酵母(Saccharomycescerevisiae)在全世界范围内被广泛应用于酒类酿造和食品发酵等行业,其被人类利用的历史已有近万年,对人类文明的发展做出了重要贡献,因此被称为“第一种家养微生物......

施一公:克服提纯问题,发布最新酵母剪接体结构

2018年5月25日,清华大学生命学院施一公教授研究组就剪接体的组装机理与结构研究于《科学》(Science)杂志以长文形式再次发表重大研究成果。这篇题为《完全组装的酿酒酵母剪接体激活前结构》(Str......

施一公连发两篇Cell文章:一步步完成剪接体的拼图

清华大学施一公教授研究组一直致力于捕捉RNA剪接过程中处于不同动态变化的剪接体结构,从而从分子层面阐释RNA剪接的工作机理。在11月16日公布的Cell杂志上,这一研究组再次发表研究论文:Struct......

清华大学生科院Cell:酿酒酵母“催化后剪接体”的结构

这篇题为StructureofthePost-catalyticSpliceosomefromSaccharomycescerevisiae的论文首次展示了pre-mRNA中3’剪接位点的识别状态,该......

基因工程菌用于肠道疾病无创检测

肠道微生物在调节和反映人体身体功能方面非常重要,微生物组的突然变化可能成为疾病检测的参考指标。将合成生物学研究用于设计构建特定化学物质的细菌传感器,能够帮助发现某些肠道疾病的微小信号。例如,肠道中硫代......

天津工生所酵母转录单元高效组装整合技术获进展

酿酒酵母广泛应用于能源燃料、化学品和天然化合物等的合成生产。开发简易高效的,能够在酵母染色体上组装整合大量转录单位的技术方法,实现复杂异源代谢途径在酵母中的组装与表达,是酵母合成生物学与代谢工程研究的......

天津大学最新文章:酵母基因组工程

生物通报道:酿酒酵母染色体的人工合成突破了真核生物基因组重新设计与合成,将引发基因组工程研究新的高潮.近期来自天津大学系统生物工程教育部重点实验室,深圳华大基因研究院等处的研究人员以酵母基因组工程为例......