基因测序为你揭开埃博拉病毒的秘密

　　2014年6月，西非埃博拉病毒爆发初期，一组研究人员以空前的规模和速度迅速破译了这一致命病毒的基因组。他们的发现揭开了病毒扩散过程中大量的关键性问题，包括病毒只通过人与人相互接触的方式传播并通过大量传播产生新变异。

　　虽然目前公共卫生官员们相信病毒最危险的阶段已经过去，事实上一切还尚未结束，先前研究工作中提出的许多问题仍然有待解答。为了解答这些问题，一个全球性的团队，其中包括来自哈佛大学（Harvard University）、博德研究所（ the Broad Institute）、美国疾病防控中心（the U.S. Centers for Disease Control and Prevention ）、过敏和传染病国家研究所（the National Institute of Allergy and Infectious Diseases，NIAID，国家卫生研究院的一部分）的人员，以及许多其他研究所的研究人员，对200多个额外埃博拉病毒样本的基因组进行了测序，力求获得目前为止最完整的信息，以此确定病毒的传播方式以及病毒长期爆发过程中发生了哪些变化。

　　为了在全球范围内引起关注，研究团队向外界公布了他们去年一整年研究获得的第一手数据。该研究的主要作者Pardis Sabeti说：这种数据共享带给我们的最大益处在于，它将如此多的杰出专家组织到了一起，共同应对病毒的挑战。

　　领导作者Danny Park说：我们从这些高分辨率测序中洞悉到一点，即在爆发以后，病毒的跨国境传播非常少。这一点非常重要，因为三个主要感染国家的边境塞拉利昂、利比里亚和几内亚被说成是破碎国境（porous borders），使得人们可以频繁往返。

　　虽然跨境接触可能引起前期爆发的扩展，但Park表示，目前明确的是，疫情一旦发生病毒不会按许多人预测的途径迁移。令人异常欣慰的是，将爆发控制在境内的措施将会起作用，这使人们得以将注意力集中在国内。

　　新的测序还能为持续爆发中病毒的进化提供见解。在爆发早期病毒迅速扩散，并累积许多突变，突变比例失调会影响蛋白功能。去年8月，研究人员注意到大多数突变都可能损伤病毒，但是爆发持续的时间还不够长，无法通过自然选择为其去芜存菁。

　　长期而言，研究团队观察到许多突变并没有长期存在，病毒基因组的变化率比长远预期的高。Park 说：埃博拉病毒从未在人类面前暴露如此长的时间，并且通过这么多次的转化，已经开始去除掉了对其自身不利的突变。

　　研究团队还证实了其他长期预期会发生的改变。例如，在一些患者身上，研究人员发现了人体酶编辑病毒基因组的证据。这种现象在埃博拉病毒中从未发生过，此前仅仅在与人类长期接触的病毒上看到过。

　　Sabeti说：在病毒爆发早期我们看到的许多突变以及长期的进化，之前在其他病毒上都观察到过。并且这些基因组数据仅能帮助阐明进化现象。这些数据只是提醒我们（就像我们所熟知那样），我们必须将这种病毒化为乌有。