阶段 3:mRNA 的提取
材料
缓冲液与溶液
按合适比例稀释贮存液。
DEPC 处理水
乙醇
NaCl(5mol/L)
酚
酚:氯仿
无二价阳离子的磷酸缓冲液(PBS)
SDS(5%m/V)
TMK 缓冲液
10 mmol/LTris-HCl(pH7.5)
10 mmol/LKCl
1 mmol/LMgCl2
Triton X-100(10%V/V) 或 Nonidet P-40(4%,V/V)
离心转头
Sorvall H1000B 转头或等同规格转头
专用设备
细胞刮子或橡胶刮
聚苯乙烯离心管(15 ml), 冰上预冷至 0°C
细胞与组织
分别经重组 pSPL3 和非重组 pSPL3 转染的 COS-7 细胞
方法
1. 用冰预冷的不含钙、镁离子的 PBS 洗涤平皿中的转染 COS-7 细胞三次。洗涤过程中将平皿保持在冰上。
2. 每个平皿中加入 10 ml 预冷的 PBS。保持平皿在冰上,小心的将细胞刮除下来。
3. 将细胞悬液转入预冷的 15 ml 聚苯乙烯离心管中。
使用透明的聚苯乙烯离心管,有利于步骤 8、9 中不含细胞核的胞浆的回收。
4.4°C、300 g(Sorvall H1000B 转头上相当于 1200r/min) 离心 8 min 回收细胞。
5. 尽可能倾去上清,并用加样器除去残存的上清。
6. 在 300ulTFK 缓冲液中重悬 1X106 至 2x106 的 COS 细胞,冰上放置 5 min。
7. 加入 15ul 的 10% 的 Triton X-100 或 4% 的 Nonidet P-40, 冰上放置 5 min。
加入非离子去污剂可导致质膜的轻微破解而核膜保持完整。
8.4°C、500 g(Sorvall H1000B 转头上相当于 1500r/min) 离心 5 min 沉淀细胞核。
9. 将上清移入预冷的 1.5 ml 小离心管中。
重要:移取上淸时应异常小心,切不可触及细胞核沉淀。如核膜破裂会导致基因组 DNA 污染,样品将非常黏期而难以吸取。
10. 加入 20ul 的 5%SDS 和 300ul 的酚,剧烈振荡后最大速度离心 5 min,样品将分为有机相和水相。
11. 将水相移入含 300ul 酚: 氯仿的 1.5 ml 小离心管中,剧烈振荡后室温最大速度离心 3 min 进行分相。
12. 移取上层的水相至预冷的 1.5 ml 小离心管中,加入 120 的 5mol/LNaCl 和 750ul 的乙醇。-20°C 放置 2~3 h 或-80°C 放置 30 min 以沉淀 RNA。
核酸在乙醇中比在水中更稳定。如长期保存,RNA 应置于乙醇中-80°C 冻存(见第 7 章,方案 1 结尾部分的专栏“RNA 的保存")。
13.4°C、最大速度离心 10 min 回收 RNA。
14. 弃上清并用 70% 乙醇洗涤沉淀。空气干燥后,将沉淀重悬于 20 g 的 DEPC 处理水中。
阶段 4: 反转录 PCR
材料
缓冲液与溶液
按合适比例稀释贮存液
10x 扩增缓冲液
氯仿
DEPC 处理水
DTT(lmol/L)
dNTP 溶液,每种核苷酸浓度为 1.25 mmol/L
酚
RNase 抑制剂
酶及缓冲液
Bst XI
EcoR V
Mo-MLV 反转录酶
Taq DNA 聚合酶
DNA 尿嘧啶糖基酶(1 单位/ul)