中国科学院大连化学物理研究所中科院分离分析化学重点实验室研究员朴海龙团队，在前期对蛋白质泛素化及去泛素化相互作用研究基础上（Oncogene，2020；iScience，2019），进一步利用生物信息学及机器学习方法，基于代谢物-蛋白质相互作用网络和癌症多组学数据定义了在代谢方面具有显著差异性的肝癌亚型，并揭示出不同肝癌亚型在预后、免疫、肿瘤微环境、甲基化调控等多个方面的特异性生物学特征。
代谢重编程是癌症核心特征之一，其作用不仅体现在代谢通路变化，还可以通过代谢物-蛋白质相互作用传播到其他生物学过程。研究人员基于代谢物-蛋白质相互作用网络和肝癌多组学数据，综合利用复杂网络和机器学习分析方法，识别了两种在疾病预后具有显著差异性的肝癌亚型。研究发现，在代谢方面，预后较差的亚型与缺氧、代谢酶的高度甲基化、众多代谢通路的下调及多种脂肪酸的累积相关。此外，众多免疫相关通路在预后较差的亚型中呈现显著上调趋势。研究人员进一步通过代谢物-蛋白质相互作用预测发现，不饱和脂肪酸与多个免疫调控蛋白（例如SRC和CTLA4）存在潜在相互作用，不饱和脂肪酸的累积可能是免疫通路上调的潜在原因。上述肝癌亚型及其生物学特征在多组独立的肝癌队列上得到验证。从外，研究人员利用肝癌细胞系，通过转录组学和代谢组学实验验证了主要计算分析结果。该研究为肝癌精准医疗提供了重要线索。
相关研究成果以Identification and Characterization of Robust Hepatocellular Carcinoma Prognostic Subtypes based on an Integrative Metabolite-protein Interaction Network为题，发表在《先进科学》（Advanced Science）上。研究工作得到国家自然科学基金、大连化物所创新基金、辽宁省自然科学基因等的资助。
基于代谢物-蛋白质相互作用的癌症代谢异质性研究
复旦大学生命科学学院研究员李晋、青年研究员黄河、樊少华与合作者研究发现，将现代人类与非人类灵长类动物区分开来的两个特征是身材更高和基础代谢率更高，他们确定了一个有助于这些特征共同进化的遗传变异，这种突......
中国科学院脑科学与智能技术卓越创新中心（神经科学研究所）研究员蔡时青团队与复旦大学公共卫生中心教授涂传涛团队合作完成，首次揭示表观遗传调控因子BAZ2B在肝脏衰老及代谢功能障碍相关性脂肪肝炎（MASH......
肝细胞癌是全球范围内预后较差的恶性肿瘤之一，治疗后易复发，患者的5年生存率仅为18%左右。晚期肝癌的治疗尤为棘手，尽管靶向治疗和免疫治疗取得了一定进展，但多轮治疗后的耐药问题突出，导致许多患者面临治疗......
中国科学技术大学孙成研究组与合作者开发出全新的“肝癌免疫预警系统”——TIMES评分系统。TIMES评分系统如同肿瘤免疫的“天气预报”，可以提前判断肝癌是否会复发，为医生提供更精准的治疗决策。肿瘤宛若......
中国国家癌症中心研究团队通过对全球肝癌流行病学进行系统分析，发现肝癌的致病因素正在发生重要转变，其中代谢性风险因素的威胁日益突出。相关研究成果于近日发表于《癌症生物学与医学》。研究者利用全球疾病负担研......
记者1月5日从厦门大学获悉，中国科学院院士、厦门大学生命科学学院教授林圣彩团队在国际学术期刊《自然》上，同期发表两篇研究论文。研究团队经过代谢组学鉴定和筛选，找到“卡路里限制”产生健康益处的关键分子—......
一、项目编号：0877-24GZTP4ZC0761二、项目名称：广东省代谢病中西医结合中心（中医药研究所）分析设备采购项目三、采购结果合同包1(中医药研究所分析设备采购项目):四、主要标的信息合同包1......
近日，记者从北京协和医院获悉，该院肝脏外科副主任（主持工作）杜顺达教授团队为一名乙肝相关肝癌的晚期患者进行了特异性T细胞免疫治疗并长期随访观察。据悉，这是全球首例乙肝特异性T细胞疗法在晚期肝癌患者中的......
9月30日，北京城市副中心医产协同示范项目荻硕贝肯免疫与代谢特检平台启动仪式在中关村通州园一方健康谷举行。该平台将进一步丰富漷县医药健康产业集聚区及副中心免疫医学科学研究及服务能力，为北京城市副中心医......
近日，中国科学院上海药物研究所谭敏佳课题组、中科中山药物创新研究院徐骏宇课题组，联合中国科学院营养与健康研究所秦骏课题组、上海交通大学附属仁济医院薛蔚和董柏君团队、上海交通大学生命科学技术学院李婧课题......