发布时间:2021-09-26 13:55 原文链接: 太赞了!质粒提取鉴定及保存

(1) 质粒的提取 (Tiangen质粒提取试剂盒):

a) 挑菌: 选取培养板中大小中等的单个菌落, 消毒牙签接种到10ml摇菌管中, 其中含有卡那霉素的LB约5ml, 37 °C, 220rpm恒温摇床中震荡培养过夜。

b) 取上述2.0ml培养液, 于常温下12000 rpm离心1分钟, 弃上清, 干燥沉淀。

c) 加入250µl溶液P1(配有去RNA酶, 4 °C保存), 涡旋振荡, 完全悬浮细菌,不能留有沉淀, 否则会影响裂解。

d) 加入250µl溶液P2, 快速上下颠倒8次, 常温静置3分钟, 可见混合液逐渐变清、 粘稠, 表示已充分裂解。

e) 再加入350 µl溶液Ⅲ, 快速上下颠倒8次, 可见白色絮状物出现。

f) 常温12000rpm离心10分钟, 所得上清液倒入已经用BL平衡过的过滤柱中,注意不要倒入白色絮状物沉淀, 静置3分钟, 12000 rpm离心1分钟。

g) 加入500 µl溶液PD, 12000 rpm离心1分钟。

h) 加入600 µl溶液PW, 12000 rpm离心1分钟; 此步骤再重复1次; 弃废液后空管再次12000 rpm离心2分钟。

i) 于超净台通风干燥, 放置2-5分钟, 加入33µl已加热至65 °C的已灭菌的ddH 2 O, 室温静置3分钟, 12000 rpm离心2分钟, 得到相关质粒DNA, 测浓度, -20 °C保存备用。

(2) 质粒鉴定及保存

取100ng上述提取的质粒, 进行酶切(反应体系见前), 随后用0.8%琼脂糖凝胶电泳以鉴定(方法同前所述), 最后将粗略鉴定正确的样本送至生物技术公司测序。 如测序正确, 用50%灭菌甘油300µl+700µl的菌液, 标记于-80 °C保存备用。

11) 质粒或PCR产物纯化(胶回收)

(1) 琼脂糖电泳酶切或 PCR 相关产物。

(2) 在紫外投射反射仪割取含有目的片段的琼脂糖凝胶片段, 割取要迅速, 以避免紫外线对 DNA 的损伤, 但注意尽量割取目的片段, 减少无目的片段的凝胶量, 以便提高纯化回收效率。

(3) 用天平称先称区空 EP 管重量, 再称取含有凝胶的 EP 管重量, 计算得到凝胶重量(mg), 加入等量体积(µl) Bindingbuffer(如 1 mg=1 μl)。

(4) 将含有凝胶的 EP 管置入 60 °C 恒温水浴箱中融化凝胶, 持续 8-10min,间或拿出摇匀, 以确保完全凝胶溶解。

(5) 将上述凝胶溶液转移至干净的纯化柱上, 室温下静置吸附 3 分钟。

(6) 将纯化柱 12000rpm 离心 1 分钟, 弃超滤液, 必要时可将超滤液重新离心1 次可提供纯化效率; 再次加入 100µl Binding buffer, 12000rpm 离心 1 分钟。

(7)加入 700µl Wash buffer (事先已经加入无水乙醇), 12000 rpm 离心 1 分钟,弃超滤液; 空管 12000 rpm 离心 2 分钟。

(8) 纯化柱置于 1.5 毫升干净离心管中, 于超净台通风干燥 5 分钟。

(9) 加入 30µl 已加热至 65 °C 的已灭菌的 ddH 2 O, 室温静置 3 分钟, 12000 rpm离心 2 分钟, 得到相应的 DNA 片段, 测浓度, -20 °C 保存备用。


相关文章

降本提效!我团队研制出系列牛用基因芯片

记者21日从国家乳业技术创新中心获悉,该中心技术研发团队成功研制出奶牛种用胚胎基因组遗传评估芯片和“高产、抗病、长生产期”功能强化基因组预测芯片。该系列基因芯片具有完全自主知识产权,填补了我国基因芯片......

新突破!便携式测序设备助阵,2小时内可诊断脑肿瘤

英国研究人员在新一期美国《神经肿瘤学杂志》上发表论文介绍,他们新开发出一种超快速脑肿瘤基因诊断方法,可以将脑肿瘤的诊断时间从此前的6至8周缩短至2小时。这种脑肿瘤基因诊断方法由英国诺丁汉大学等机构的研......

重大突破!新加坡发布长读长RNA测序数据集SGNEx

由新加坡科技研究局基因组研究所领导的科学家团队,发布了迄今全球最大、最全面的长读长RNA测序数据集之一——新加坡纳米孔表达数据集(SG-NEx)。这一成果有望解决疾病研究中长期存在的技术瓶颈,使研究人......

猿类基因组测序为人类进化研究提供“里程碑”视角

经过20多年的努力,科研人员成功地对6种现存猿类的基因组进行了完整测序,为研究人类进化提供了近距离视角,这被英国《自然》杂志称为“遗传学的一个里程碑”。123名来自多个国家和地区的科研人员组成的团队9......

预算887.8万昆明医科大学第二附属医院2025年05月(至)2025年06月政府采购意向

昆明医科大学第二附属医院2025年05月(至)2025年06月政府采购意向为便于供应商及时了解政府采购信息,根据《财政部关于开展政府采购意向公开工作的通知》(财库〔2020〕10号)等有关规定,现将昆......

因美纳被制裁背后:一家测序巨头的中国困局

事件焦点:为什么是它?3月4日,中国将美国基因测序公司因美纳(Illumina)列入“不可靠实体清单”,引发行业震动。这家生产基因测序仪的公司看似低调,却是全球生物实验室的“水电煤”——它的设备几乎垄......

人转录组测序内参标准物质

通过转录组测序获得人的基因表达谱数据,能进一步挖掘疾病相关的生物标志物,为临床诊断提供依据。目前,由于转录组测序无法溯源,导致不同实验室及测序平台产出的数据可比性和测序结果的准确性面临挑战。中国计量科......

科学家测序动物界最大基因组

科技日报北京8月15日电(记者张佳欣)据最新一期《自然》杂志报道,德国康斯坦茨大学和维尔茨堡大学领导的国际研究团队,对动物界最大基因组的拥有者——肺鱼进行了基因组测序。肺鱼基因组约为人类基因组大小的3......

动物保护新动作,300多种反刍动物基因组将测序

据最新一期《自然·遗传学》杂志报道,由多个机构组成的国际“端粒对端粒(T2T)”联盟正在推进“反刍动物端粒-端粒”项目,旨在对300多种反刍动物的基因组进行测序。研究团队期望通过测序得到的基因组图谱,......

预测蛋白质序列的新AI模型问世

瑞士洛桑联邦理工学院开发了一种名为CARBonAra的新型人工智能(AI)驱动模型。该模型可以根据不同分子环境所施加限制的主链支架预测蛋白质序列,有望在蛋白质工程及包括医学和生物技术在内的多个领域带来......