安捷伦科技将 CGH 和 SNP 分析结合到同一芯片上
创造出一款独具特色的细胞遗传学工具
2010 年 10 月 11 日,北京——安捷伦科技公司(纽约证交所:A)今日推出 SurePrint G3 Human CGH+SNP 芯片平台,这一创新型的系统能够同时分析染色体拷贝数改变和不改变的染色体畸变。该系统可以帮助科研人员研究发育性疾病以及多种癌症的遗传机理。
这是目前市场上唯一检测杂合性丢失和单亲二倍体(LOH/UPD)的双色 CGH 分析平台,分辨率可达 5 至 10兆碱基。
贝勒医学院分子人类遗传学系主任 Arthur Beaudet 博士说,“我们终于拥有一款芯片,它不仅具有最佳的拷贝数检测能力,可以覆盖所有外显子,而且还具有 SNP 分析能力,可以检测由 UPD 或近亲结婚引起的杂合性缺失 [LOH]。”
安捷伦 CGH 芯片产品经理 Anniek De Witte 表示,“我们将 SNP 探针加入到已经被广泛使用的 安捷伦CGH 芯片设计中,开发出一款可以同时有效检测拷贝数变化及无拷贝数变化的 LOH/UPD 的强大工具,进而获得更详细和完整的基因组畸变图谱,对此我们相当兴奋。相比我们以前推出的 CGH 芯片,这一新产品的分辨率、准确性和灵敏度同样出色,绝不会让研究者失望。”
安捷伦 SurePrint G3 CGH+SNP 芯片提供目录版和定制版,与我们目前的芯片形式类似。您可通过安捷伦免费的eArray在线工具或eArray XD 单机版轻松完成定制芯片的设计。
SurePrint CGH+SNP 4x180K 和 2x400K 两款型号的芯片均可检测大约 60000 个 SNP,因此,检测整个基因组的 LOH/UPD 时分辨率可达到约 5 至 10 兆碱基。4x180K芯片上的约 120000 个 CGH 探针,由包括细胞遗传学芯片国际标准联合会 (ISCA,) 推荐的8x60K 检测芯片中所有的探针以及额外的 60000 个骨架探针组成。2x400K 芯片上的约 300000 个 CGH 探针覆盖了基因组最重要的区域,侧重于基因和外显子。
SurePrint G3 CGH+SNP 芯片使用与现有的CGH单一检测芯片相同的高通量工作流程,因此能够简单高效地应用于细胞遗传学研究。安捷伦的Genomic Workbench软件采用创新算法,利用 CGH 探针计算拷贝数变化,通过 SNP 探针测定等位基因特异性拷贝数以及定位 LOH/UPD 区域,弥补了现有芯片分析的不足。该软件可以同时分析 CGH 和 SNP 数据,计算QC参数,并以此确保高可信度的数据评估。
关于安捷伦科技公司
安捷伦科技公司(纽约证交所:A)是全球领先的测量公司,是化学分析、生命科学、电子和通信领域的技术领导者。公司的 18,500 名员工在 100 多个国家为客户服务。在 2009 财政年度,安捷伦的业务净收入为 45 亿美元。
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