近年来质谱仪性能的显著改进主要基于开发出的两种离子化技术：一种是介质辅助的激光解吸/离子化技术。另一种是电喷雾离子化技术。由于这两种电离技术的出现，使原本只能检测小分支的质谱技术，可以运用于检测生物大分子。
在过去质谱技术主要运用于对一级结构和序列的表征，而现在质谱技术越来越多地运用于高级结构的分析，而高级结构对于抗体药物的生物活性至关重要。
随着抗体药物的不断发展，需要对于抗体药物的结构信息不断进行深入的分析，质谱技术也随着这一要求不断进步。随着技术的进步，可以预见质谱分析会越来越多地运用于抗体分析中，特别是在高级结构分析的领域，通过质谱分析，可以让我们更多获得高级结构的信息，这对于抗体药物的分析是极为重要的。本文涵盖了与现代质谱实践相关的广泛主题，并回答了有关质谱仪使用和功能的一些常见问题。
质谱简史
1897年—现代质谱（MS）归功于英国曼彻斯特JJ Thomson的阴极射线管实验。
1953年—沃尔夫冈·保罗（Wolfgang Paul）发明的四极和四极离子阱为他赢得了诺贝尔物理学奖。
1968年—马尔科姆·多尔（Malcolm Dole）开发了当代电喷雾电离（ESI）。在真空中产生气溶胶会产生蒸气，这种蒸气被认为很难实用。液体的体积增加了其冷凝相的100到1000倍（标准条件下1 mL/ min的水将产生1 L / min的蒸汽）。
1974年—Horning在很大程度上基于气相色谱（GC）技术开发了大气压化学电离（APCI），但并未广泛采用。
1983年— Vestal和Blakely加热液体流的工作被称为热喷涂。它成为当今商业上适用的工具的预兆。
1984年—芬恩在ESI的工作发表，使其在1988年获得诺贝尔奖。
为什么要使用质谱分析？
医药工业领域的工作人员在进行药物研发和药物开发时需要利用MS的特异性、动态范围及其灵敏度，区分复杂基质中紧密相关的代谢物，从而鉴定并量化代谢物。尤其是在药物的开发过程中，药物需要进行相应的鉴定、纯化，确定早期的药代动力学，MS已经证实是不可或缺的工具。
生物化学家扩展了MS的使用领域，将其应用到蛋白、肽和寡核苷酸的分析中。使用质谱仪，生物化学家们能够监测酶的反应，确定氨基酸序列，并通过包含有蛋白裂解片段衍生物样品数据库鉴别大分子蛋白。生物化学家通过氢－氘交换在生理条件下形成重要的蛋白-配体的复合物，监测蛋白质的折叠。临床化学家在药物检测和新生儿筛查中也应用MS，取代结果不确定的免疫分析。食品安全和环境研究人员也是这样。他们跟行业中相关的企业工作人员一样，也使用MS，比如：PAH和PCB分析，水质量分析，及食品农药残留分析。确定油组成是一项复杂且昂贵的工作，这刺激了早期质谱仪的发展，并不断推动该技术的继续创新。现今，MS的专业人员可以在各种质谱仪、一系列完善可靠的电离技术中进行选择。
你在考虑使用质谱仪（MS）之前，应当考虑一下这些问题：您分析的是蛋白质、肽等大分子，还是获取水溶性小分子的数据？您是在寻找目标化合物，还是表征未知样品？针对复杂基质，您当前的分离技术能到达所需要的纯度吗，或者您必须开发新的纯化方法？您要求单位质量精度（比如400 MW），或5ppm的质量精度（比如，400.0125 MW或质量为400时准确度为2mDa）？这些问题都是应该有所考虑的。
什么是质谱？质谱是怎样工作的？