布鲁克发布全新空间单细胞代谢组学研究策略

　　摘要

　　* 创新的无偏原位空间单细胞代谢组学（SSCM）能够以单细胞分辨率实现高通量代谢组织样本表征；

　　* 基于 timsTOF fleX MALDI 的全新 5 μm microGRID 技术可在大视场内提供几乎无伪影的小分子图像；

　　* 创新的 4D-代谢组学可通过 CCS-Predict Pro AI/DL 功能预测分子碰撞横截面（CCS），进一步丰富脂质、代谢物和糖苷的数据库.

　　2022年6月21日西班牙瓦伦西亚  --在第 18 届代谢组学学会国际会议上，布鲁克公司（纳斯达克股票代码：BRKR）宣布了空间多组学的关键创新是无偏空间单细胞代谢组学（SSCM），它被用于探测基于组织和单细胞代谢特征的差异细胞表型。

　　SSCM 与最近发布的 MALDI HiPLEX-IHC 工作流程相结合，可用于原位单细胞免疫代谢组学研究，从而实现了将基于代谢组学的免疫重编程与靶向蛋白质组学的整合。这种单细胞多组学工作流程基于 timsTOF fleX 系统的新型 microGRID smartbeam 3D MALDI 源，可用于亚微米定位、空间分辨率低至 5 微米（5 μm），几乎消除了 MALDI 分子图像与光学显微镜共定位中的任何伪影。

　　单细胞技术彻底改变了人们对癌症、再生医学、衰老和肝病背后的生物过程的异质性的理解。研究细胞间组织变异可以加强转化研究，例如，在癌症研究方法领域，开发针对罕见肿瘤细胞的治疗方法。

　　德国海德堡 EMBL 代谢组学核心设施和分子医学合作部门负责人 Theodore Alexandrov 教授，将在丹麦哥本哈根生物创新研究所 BioStudio 工作室主持名为 SpaceM 的新项目，重点研究用于药物开发和精准医学的单细胞代谢组学。

　　Alexandrov 博士评论说：“我们正在将 EMBL 海德堡开发的 SpaceM 空间单细胞代谢组学技术，开发成为快速药物发现的平台。作为哥本哈根生物创新研究所 BioStudio 项目的一部分，我们将使用 timsTOF fleX MALDI-2 成像系统对单细胞进行快速、灵敏和特异性原位分析，以确定其代谢状态。此外，最新的 microGRID 技术将为我们提供精准检测单个细胞所需的高空间分辨率。

　　布鲁克公司还推出了用于代谢组学分析与定量的新一代 MetaboScape® 和 TASQ® 软件。MetaboScape 2022b 集成了 CCS-Predict Pro 机器学习算法，timsTOF 平台上测量的准确且可重复的 CCS 值可以与从化合物库或 biotransformation 算法中预测的 CCS 值相匹配，从而为化合物注释添加了一个正交维度，使注释结果更加可靠。

　　TASQ 2022b 的目标物筛查与定量的工作流程增加了同位素示踪工作流程，同样支持 CCS 值的匹配。由于提供了天然同位素的矫正方法和同位素标记分数贡献等关键算法，大规模稳定同位素示踪实验的数据处理得到简化。