庚二酸是一种重要的有机化工原料，是合成增塑剂、润滑油、导热油、介电流体、纤维、高分子共聚体、聚丙烯成核剂、墨水、涂料树脂、表面活性剂、杀菌剂、杀虫剂、粘合剂等的原料；
庚二酸也用于生化研究、制取生物医药、配体合成。例如用作生物试剂氨基酸蛋白质和培养基、核酸及其衍生物染色剂、抗生素和维生素、内切酶和修饰酶、分离试剂酶和辅酶生物缓冲液等。
