发布时间:2016-07-20 16:54 原文链接: 循环肿瘤DNA片段更短小有助开发液体活检新技术

  根据一项发表在国际学术期刊Plos Genetics上的最新研究,循环肿瘤DNA与正常游离DNA在长度上存在差别,据此或可利用病人血液帮助开发检测肿瘤DNA的液体活检新技术。

  液体活检技术可以从血液中发现和诊断癌症,还可以帮助监测癌症复发,评估治疗效果,但是这项技术仍然存在监测灵敏度的问题,大大限制了该技术的发展。美国犹他大学和华盛顿大学的研究人员发现,相比于正常细胞的DNA片段,来源于肿瘤细胞的循环DNA长度更短。

  文章作者Hunter Underhill表示:“根据不同来源的循环DNA片段长度不同,可以检测到实体瘤的存在。”

  研究人员在多形性成胶质细胞瘤小鼠模型中发现了上述现象。在研究中他们将人的多形性成胶质细胞瘤干细胞样系导入小鼠脑部,随后在血液中检测到了人类ctDNA,他们对比了人类肿瘤来源ctDNA和小鼠正常游离DNA的差别,发现人类ctDNA的长度一般为134个碱基,而小鼠正常游离DNA长度一般为167个碱基。研究人员还将人类肝细胞癌细胞植入小鼠体内也发现了类似现象,这表明循环肿瘤DNA长度更短是相对普遍的现象。

  随后研究人员还对黑色素瘤患者和健康人体内的游离DNA进行了对比,他们发现黑色素瘤患者的游离DNA片段普遍更短。他们还对比了肺癌患者和健康人的游离DNA,结果表明肺癌患者来源的游离DNA长度也更短小。

  研究人员对比了来自于EGFR T790M突变肺癌患者和健康人循环DNA测序文库,结果发现当DNA片段比平均长度短20到50个碱基时,该片段等位基因的突变率提升2.5到9.1倍。这说明短的游离DNA可提示更高的等位基因突变率。

  作者表示,对短的游离DNA进行准确筛查将有助于等位基因突变及肿瘤的发现,但其中的机制还需要更多研究进行进一步揭示。

相关文章

从时空尺度揭示DNA内部隐藏世界

在近日一项发表于《自然》的研究中,科学家绘制出迄今最详尽的人类活细胞内DNA折叠、环状缠绕和移动的图谱,展示了基因组结构随时间推移的变化情况,揭示了隐藏的基因调控机制,是了解DNA结构如何塑造人类生物......

我国学者在快速低成本基因测序方法研究方面取得进展

图基于卷对卷流体的新一代快速低成本基因测序技术在国家自然科学基金项目(批准号:22027805、22334004、22421002)等资助下,福州大学杨黄浩、陈秋水团队与华大生命科学研究院秦彦哲、章文......

荧光传感器实时监测DNA损伤及修复

荷兰乌得勒支大学研究人员开发出一款全新荧光传感器,可在活细胞乃至活体生物中实时监测DNA损伤及修复过程,为癌症研究、药物安全测试和衰老生物学等领域提供了重要的新工具。相关成果发表于新一期《自然·通讯》......

方显杨研究组与合作者共同开发了一种新型活细胞DNA成像技术

三维基因组互作与表观遗传修饰是基因表达调控的重要因素,其动态变化与细胞生长发育及癌症等疾病的发生发展密切相关。解析染色质在活细胞内的时空动态,是理解基因调控机制的重要科学问题。现有基于CRISPR-C......

拿破仑的军队是如何灭亡的?DNA揭示令人意外的疾病因素

1812年,法国皇帝拿破仑一世从俄罗斯莫斯科撤退时,其大部分军队因饥饿、疾病和寒冷的冬天而损失殆尽。如今,对这撤退途中丧生的30万士兵的部分遗骸的DNA的分析发现,两种未曾预料到的细菌性疾病很可能增加......

DNA揭示拿破仑军队“全军覆没”元凶

1812年夏,法兰西皇帝拿破仑·波拿巴率50万大军入侵俄罗斯帝国。然而到12月时,这支军队仅余零星残部。历史记载将此次“全军覆没”归因于饥寒交迫与斑疹伤寒。但一项新研究表示,从士兵牙齿中提取的DNA,......

“DNA花朵”微型机器人可自适应环境变化

美国北卡罗来纳大学研究团队研发出一种名为“DNA花朵”的微型机器人。这种机器人具有独特的自适应环境变化能力,能够像生物体一样,根据周围环境改变形状和行为。“DNA花朵”机器人由DNA与无机材料结合形成......

DNA搜索引擎MetaGraph研发成功

瑞士苏黎世联邦理工学院科学家在最新一期《自然》杂志上发表论文称,他们开发出一款名为MetaGraph的DNA搜索引擎,能快速、高效地检索公共生物学数据库中的海量信息,为研究生命科学提供了强大的专业工具......

破解人脑独特性的关键DNA片段发现

究竟是什么让人脑与众不同?美国加州大学圣迭戈分校研究团队发现了一个名为HAR123的小型DNA片段,这将是解开人类大脑独特性之谜的关键。相关研究成果发表于新一期《科学进展》杂志。最新研究表明,HAR1......

破解人脑独特性的关键DNA片段发现

究竟是什么让人脑与众不同?美国加州大学圣迭戈分校研究团队发现了一个名为HAR123的小型DNA片段,这将是解开人类大脑独特性之谜的关键。相关研究成果发表于新一期《科学进展》杂志。最新研究表明,HAR1......