不论病因为何，所有肝腺泡均受累，出现斑片状坏死及肝细胞嗜酸性坏死和单核细胞炎性浸润。即使在疾病的早期，肝脏也可出现再生的组织学变化。除非肝细胞广泛桥接坏死并贯穿整个腺泡，否则肝脏的基本网架往往不被破坏，而且组织学改变可完全恢复。在大多数病例，不管是哪一种病毒引起的肝脏病理学变化均很相似。乙肝病毒有时通过检出"毛玻璃样"肝细胞（因HBsAg累及胞浆）和对病毒成分的特殊免疫学染色可确诊。然而，这些结果在急性乙型肝炎时很少出现阳性，而在慢性乙型肝炎时很典型，丙型肝炎有时可能根据一些微小的形态学变化而作出判断。