此病多发生于女性，可在任何年龄发病。婴儿常有持续性鹅口疮。病变轻者仅累及指甲，重者全身皮肤、黏膜和毛发受累。皮肤有鳞屑、湿疹，黏膜有念珠菌粘着性白斑，指甲营养不良或角化过度。慢性食管念珠菌病可致食管狭窄，并可伴发鼻窦及肺部感染。患儿生长发育障碍，老年发病者一般较轻。
另一类型是少年家族性多内分泌综合征伴念珠菌病，除有轻至中度念珠菌病外，一般在念珠菌发病后数年出现甲状腺功能减退、甲状旁腺功能减退、Addison病或糖尿病。通常可查到受累内分泌器官的自身抗体。此外，尚可并发卵巢功能障碍、恶性贫血、脱发和慢性活动性肝炎等。