来自中国医学科学院、清华大学的研究人员在新研究中证实,在拟南芥中cma33 / XCT通过调节Dicer-Like(DCL)基因的转录调控了小RNA(sRNA)的生成。这一研究发现发表在8月刊的《分子植物》(Molecular Plant)杂志上。
现任职于中国医学科学院及清华大学的戚益军(Yijun Qi)教授是这篇文章的通讯作者。戚益军是RNAi方面的专家,研究居国际领先水平。近年来在Cell、Nature、Mol Cell等国际顶级杂志上发表了多篇重要的研究论文。
小分子RNA(Small RNAs ,sRNAs)是一类长约20-30核苷酸(nt)的非编码RNA分子,其介导的转录后基因调控是一种新型的基因调控机制。它在植物生物学的各个方面,包括生长发育和适应外界各种环境胁迫的过程起着非常重要的调控作用。
在拟南芥中sRNAs主要分为三类DCL1依赖性microRNA (miRNA)、DCL3依赖性异染色质siRNA (hc-siRNA)和DCL4依赖性反式作用siRNA (ta-siRNA)。拟南芥中已知的sRNA都是经Dicer类似蛋白(Dicer-like, DCL)加工双链RNA前体而产生。
miRNA是一类大约21个核苷酸长的sRNA。miRNA的产生过程包括由PolII转录出其前体(pri-miRNA)和由DCL1对pri-miRNA进行加工形成成熟的niRNA两个过程。miRNA与ARGONAUTE1(AGO1)结合形成RNA沉默复合物(RISC),主要通过切割靶基因mRNA或抑制翻译调节基因表达。在以往的研究中,戚益军教授课题组发现了一种miRNA活性减弱的突变体cma33。
在这篇文章中,研究人员鉴定和研究了cma33突变体。证实CMA33编码了一个核蛋白XAP5 CIRCADIAN TIMEKEEPER (XCT),XCT之前被发现调节了植物的节律和乙烯反应。他们发现在ma33/xct突变体中,miRNA和hc-siRNAs、ta-siRNAs的累积均下降。进一步,他们发现cma33/xct突变体导致了DCL1、DCL3和DCL4表达量下降,但未影响sRNA生物合成信号通路中其他的基因。与此相一致,CMA33/XCT突变体中Pol II在这三个DCL基因上的结合减少。
这些研究数据表明了,CMA33/XCT通过调控DCL1、DCL3和DCL4的转录调节了sRNA的生成。
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