下呼吸道感染,包括肺炎和毛细支气管炎,是全世界五岁以下儿童的主要死因之一。近日,英国爱丁堡皇后医学研究所的研究人员与其荷兰合作团队进行的研究发现,儿童鼻咽部的微生物组有助于这类感染诊断,而且打破了传统诊治观念。
下呼吸道感染通常是因上呼吸道中的病原性病毒和细菌侵入呼吸道粘膜而引起,但并非所有儿童在接触病原体后都会出现症状,如呼吸急促、虚弱和发烧等。而且,在健康儿童的上呼吸道中,也常常有这些病原性微生物。因此,研究人员提出了一个有意思的设想:上呼吸道中微生物组的平衡状态可能会影响儿童下呼吸道感染的风险。
首先需要回答的问题是,上呼吸道和下呼吸道中的微生物组有怎样的联系?研究人员在29名4周-5岁的重症患儿中进行了前瞻性研究。这些患儿符合世界卫生组织所定义的需要接受机械通气的下呼吸道感染。对他们的鼻咽拭子和气管深部吸出物分析显示,个体内这两部分的病毒和细菌特征高度一致。也就是说,对于下呼吸道感染,鼻咽拭子可以代表肺部微生物组的情况。
确定微生物组样本后,需要进一步分析微生物组情况对感染的具体影响,研究人员继续进行了病例对照研究。他们分别招募了年龄、性别、微生物组取样季节等匹配的154名患儿和307名健康儿童。比较这两组儿童的鼻咽拭子发现,与健康儿童相比,下呼吸道感染患儿的微生物组特征截然不同,包括病毒或细菌的数量和类型,都不一样。

下呼吸道感染患儿和健康儿童鼻咽部的病毒特征差异。RSV:呼吸道合胞病毒,hMPV:人类偏肺病毒。(图片来源:参考资料)
根据统计模型,结合儿童年龄等易感因素,鼻咽部的微生物组特征可以预测儿童是否会出现下呼吸道感染,准确度高达92%。通过反应感染严重程度,这些微生物组差异还可以用来预测患儿住院的时间,并识别出那些有望自然恢复的患儿。

领导研究的Debby Bogaert教授(图片来源:爱丁堡大学官网)
领导这项研究的Debby Bogaert教授来自爱丁堡大学医学研究委员会炎症研究中心,她表示:“我们的研究结果首次表明,呼吸道中的微生物组对呼吸系统健康非常重要,而非单一的某种病毒或细菌。”
研究团队指出,这有助于预防严重肺部感染,通过微生物组差异,可以解释为什么有些孩子更容易发生感染。更重要的是,这一发现打破了传统诊治观念。既往医生会根据症状来判断致病微生物是病毒(毛细支气管炎)或细菌(肺炎),并在此基础上用药。但这项研究的数据模型为未来基于微生物组的诊断工具打下了基础,有助于选择最佳治疗策略,并改善抗生素应用。
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