抗小肠杯状细胞抗体能帮助诊断炎症性肠病,常用间接免疫荧光法测定。高滴度的抗小肠杯状细胞抗体主要见于溃疡性结肠炎,阳性率达28%~39%。部分克罗恩病患者也可检出抗小肠杯状细胞抗体。在炎症性肠病患者的近亲中检出抗小肠杯状细胞抗体,预示易患炎症性肠病。