文献速递|猴痘病毒系统发育和微进化

近日，Nature Medicine在线发表了葡萄牙里斯本国家卫生研究所的一项研究，题为“Phylogenomic characterization and signs of microevolution in the 2022 multi-country outbreak of monkeypox virus” （2022年多国暴发猴痘病毒的系统基因组学特征和微进化迹象），该研究利用宏基因组测序对目前爆发的猴痘病毒进行了系统发育分析，并突出了宿主对其进化的作用。

猴痘是一种罕见的人畜共患疾病，由正痘病毒属的猴痘病毒（MPXV）引起，潜伏期为5-21天，通常以发热、肌痛、疲劳和头痛开始，然后在原发感染部位出现斑丘疹，可扩散至身体其他部位。猴痘病毒的自然宿主仍然未知，但啮齿动物和非人灵长类动物可能携带该病毒。猴痘病毒主要在西非和中非本土流行，罕见的大范围传播可能与进口物品相关。猴痘病毒的传播主要通过接触传播的方式实现。然而目前对于猴痘病毒的了解相当有限，关键问题在于猴痘病毒完整基因组还未获得。

本研究中研究者首次报道了2022猴痘疫情的病毒序列，通过与数据库序列比对发现，该毒株属于第3分支，主要在西非地区流行。目前爆发的猴痘病毒序列相似度很高，因此具有同一个源头，研究者推测此次爆发的毒株可能是2017-2018尼加拉瓜疫情爆发后通过进口传播到其他国家，持续性隐秘传播所致。

2022猴痘病毒存在50多个单核苷酸多态性位点，这种快速产生的点突变可能与宿主APOBEC3蛋白相关。同时一些非结构蛋白的突变可能影响了病毒与宿主免疫系统的相互作用。