在细胞中,DNA及其相关物质每隔一定时间就会复制,这是所有有机体必不可少的一个过程。这导致了从身体对疾病作出的反应到头发颜色在内的一切。DNA复制是在20世纪50年代后期确定的,但是从那以后,全球各地的研究人员都试图了解这一过程是如何精确地受到调节的。如今,科学家们知道了。
在一项新的研究中,来自美国佛罗里达州立大学的研究人员解开了一个存在了几十年的关于一种关键的细胞过程---DNA复制---如何受到调节以及这对未来的遗传学研究意味着什么的谜团。他们发现DNA分子中存在着控制DNA复制的特定位点。相关研究结果于2018年12月27日在线发表在Cell期刊上,论文标题为“Identifying cis Elements for Spatiotemporal Control of Mammalian DNA Replication”。论文通讯作者为佛罗里达州立大学分子生物学教授David Gilbert博士。论文第一作者为博士生Jiao Sima。
图片来自Cell, doi:10.1016/j.cell.2018.11.036。
Gilbert说,“这真是一个谜。DNA复制似乎对我们试图干扰它的所有事情都很有弹性。我们已详细描述了它,发现它在不同细胞类型中发生变化,并且它在疾病中受到破坏。但是迄今为止,我们找不到控制DNA复制的控制元件或者说DNA序列。”
值得注意的是,Gilbert的教授职位是为了纪念前佛罗里达州教授J. Herbert Taylor。Taylor在20世纪50年代后期发现了不同的染色体片段如何进行复制,并发表了100多篇关于染色体结构和复制的论文。大约60年后,Gilbert确定了DNA复制如何受到调节。
Sima在实验室里与Gilbert一起工作,并在DNA分子上产生了将近一百个基因突变,希望看到某种更好地解释这种复制过程的工作原理的结果。Gilbert说,在遭受一系列挫折之后,他们在万般无奈下孤注一掷。
Gilbert和Sima以尽可能最高的三维分辨率研究了DNA的单个片段,并且看到DNA分子上的三个序列经常相互接触。这些研究人员随后使用一种先进的基因编辑技术CRISPR同时移除这三个区域。通过这样做,他们发现这三个区域一起是DNA复制的关键。
Gilbert 说,“移除这三个区域会导致DNA复制时间从这个过程的最初阶段转移到它的最后阶段。这个结果让人大吃一惊。”
除了对DNA复制时间的影响之外,移除这三个区域导致DNA分子的三维结构发生显著变化。
Sima说,“我们首次在基因组中精确确定了调控染色质结构和DNA复制时间的特定DNA序列。这些结果反映了一种可能的模型,即DNA如何在细胞内折叠以及这些折叠模式如何影响遗传物质的功能。”
更好地理解DNA复制是如何被调节的,开辟了遗传学研究的新途径。当DNA复制时间发生变化---正如Gilbert和Sima的实验所展现的那样---时,它能够完全改变细胞遗传信息的解释方式。
当科学家们应对DNA复制时间受到干扰的复杂疾病时,这可能成为关键信息。Gilbert说,“如果在不同的地方和时间发生进行DNA复制,那么这可能组装出一种完全不同的结构。细胞在不同的时间有不同的东西可用。改变DNA复制发生的时间会改变遗传信息的组装。”
回声定位是动物通过声音信号感知环境、实现导航和捕食的重要生物性状。该性状由多系统协同构成,广泛存在于哺乳动物与鸟类中,是生物趋同演化的典型案例。近期,中国科学院昆明动物研究所研究团队以声学特征为切入点......
迄今规模最大的古代人类DNA研究表明,人类进化在过去1万年里明显加快。这项由美国哈佛医学院的群体遗传学家DavidReich联合主导的研究,4月15日发表于《自然》。研究人员在涵盖欧洲和中东地区的古代......
近日,中国科学院青岛生物能源与过程研究所单细胞中心与中国科学院天津工业生物技术研究所合作,研究开发了一种集成的、高灵敏度且高通量的错误校正平台eMBS。能够通过理性设计工程化MutS蛋白并结合磁珠分离......
据报道,上个月法国发生的一起案件,在一把枪上发现了同卵双胞胎兄弟的DNA,但他们拥有相同的DNA,所以传统的DNA检测方法,无法确定DNA属于哪位兄弟。在法国一起刑事审判中,传统的DNA检测未能区分出......
中国古生物学科研团队对滇西北香格里拉叶卡早更新世早期哺乳动物化石群开展的最新研究发现,香格里拉地区早更新世哺乳动物组合呈现出南北类群混合的特征,其物种组成上与元谋动物群最接近,二者共享多个标志性物种。......
27日的《科学》杂志发表了一项研究,揭示了人类基因组中一类可“跳跃”的DNA片段——被称为遗传“寄生虫”的LINE-1(L1)元件,如何成为破坏癌症基因组稳定性的主要力量。基因组的不稳定正是癌症演化的......
一艘沉没于150年前的船经历了怎样的航程?科研人员从出水瓷瓶内的沉积物中,“打捞”出了它的生命史。通过对长江口二号沉船出水青花双耳瓶中的土壤沉积物进行环境因子与沉积物古DNA分析,来自复旦大学、华东师......
在近日一项发表于《自然》的研究中,科学家绘制出迄今最详尽的人类活细胞内DNA折叠、环状缠绕和移动的图谱,展示了基因组结构随时间推移的变化情况,揭示了隐藏的基因调控机制,是了解DNA结构如何塑造人类生物......
图基于卷对卷流体的新一代快速低成本基因测序技术在国家自然科学基金项目(批准号:22027805、22334004、22421002)等资助下,福州大学杨黄浩、陈秋水团队与华大生命科学研究院秦彦哲、章文......
荷兰乌得勒支大学研究人员开发出一款全新荧光传感器,可在活细胞乃至活体生物中实时监测DNA损伤及修复过程,为癌症研究、药物安全测试和衰老生物学等领域提供了重要的新工具。相关成果发表于新一期《自然·通讯》......