
图9:ESI注入8细胞阶段的胚胎。钝端毛细管

图10:EMBL转基因过程中使用的DMi8、Eppendorf TransferMan 4r显微操作器和PiezoXpert压电破膜仪。以钝端毛细管进行胚囊注射。DIC
用于小鼠转基因的CRISPR/Cas 9技术
用于小鼠转基因的CRISPR/Cas9技术为靶向突变提供了工具(如ESI),但无需繁杂的ES处理工作!(当然CRISPR也可以用于ES细胞突变)。
转录激活子样效应因子核酸酶(TALEN)技术是一种更为成熟的技术。TALE(转录激活子样效应因子)是结合DNA特定序列的蛋白质。TALE与核酸酶融合即为TALEN,这是一种具有高度特异性的DNA剪刀。TALEN使双链断裂。修复机制导致靶基因缺失或敲除。
目前,CRISPR技术相对于TALEN技术而言并不昂贵。
另外一种基因组编辑技术是锌指核酸酶技术,它通过在用户指定位置上造成DNA双链断裂而发生作用。
CRIPR/Cas9技术所用的工具如下所示:
向导RNA:这种RNA与用户修饰的靶DNA同源。向导RNA与DNA上的大约20个核苷酸结合。RNA链的其余部分用于结合Cas9核酸内切酶。需要对20个结合的核苷酸进行设计,以找到/发现靶序列。
Cas9核酸内切酶:切割效率高,有时甚至切割两个等位基因。
将向导RNA和Cas9蛋白(或Cas9的DNA或mRNA)注射到受精卵里,Cas 9切割DNA,修复机制开始起作用。该方法在第一代小鼠体内产生点突变的概率高。更先进的技术是注射携带靶基因或突变的同源DNA以及向导RNA/Cas9混合体。经由同源重组插入DNA相当有效。
小鼠转基因用CRISPR/Cas9的优点/缺点:
优点:
+ Cas 9切割效率非常高,有时甚至切割两个等位基因,即可获得同源1代小鼠!
+ 无需繁琐的ES细胞处理工作
+ CRISPR/Cas9技术不依赖于小鼠(而PNI和ESI则依赖),即它也可用于其他物种 (猪等)。
缺点:
- 迄今已公布的最长插入片段为3kB
- 目前lox P条件性敲除效率低
需要注射高浓度黏性分子(如RNA、蛋白质),会堵塞毛细管。因此需要更粗的毛细管,而且要求平角注射!

Cas9高效率地剪切DNA,DNA的修复机制造成了点突变。

*注射gDNA+Cas9+同源的DNA

图11:CRISPR/Cas9技术
典型的CRISPR/Cas9系统设置
与PN注射设置相同,以下除外:
将浓度较高的黏性CRISPR成分(RNA、蛋白质)注入受精卵时需要使用较粗的毛细管。这些毛细管结构笔直,内径较大,大多数实验室均制作。
因此极力建议沿着真正的平角方向注射(见图10),以避免胚胎受损。
此外,使用Piezo压电式破膜系统,可以更轻松地穿过透明带,尤其是质膜。
显微操作器水平移动,将目标片段注入悬浮细胞内

图12:受精卵注射过程的注射角度。显微操作器水平移动,零度角注射可使胚胎受损程度较轻。注射角度大于10° 将导致受精卵出现较大的“洞”,使其存活率降低。
徕卡显微操作器的移动角度可调,也就是说,即便角度较陡,注射角度本身也是零度角!
这是徕卡显微操作器的一大优点:黏性的向导RNA和cas9蛋白混合物所需的较粗毛细管(减少堵塞)可以沿着零度角方向注射!
其他实验室设备(转基因实验室)
-立体显微镜是选择和控制胚囊、ES细胞和毛细管必不可少的工具。(如TL5000、M80、Rottermann contrast)

图13:M80及TL5000 Ergo。PN注射后的双细胞阶段。
DIC专用玻璃底器皿,一些实验室使用大号盖玻片
毛细管:若干公司提供即买即用产品。许多转基因实验室自己制作毛细管。
直线注射CRISPR/Cas9需要使用内径足够大的毛细管。转基因专家自己制作“高级”毛细管以达到最高效率。
需要工具:
拉针器(如Sutter、Narishige)
磨具(用于毛细管拉拔后加工)
显微拉制仪(用于弯曲毛细管)
上述显微操作器:
徕卡机械式显微操作器:转基因领域赞誉颇高的显微操作器类型。角度可调,即使毛细管角度较陡,也可获得零度注射角。稳健可靠,负载能力强,持久耐用。用户众多。当移动徕卡显微操作器的控制杆时,可以感觉到毛细管触及胚胎。
Eppendorf TransferMan4r:全自动显微操作器,具有许多附加功能。可以平角注射。气压式、油压式、油压式带齿轮和Femtojet手动显微注射器经常用于其他显微操作器。性能最优,价格最高。
Narishige:新式Takanome显微操作器无平角操作功能。配备MOM-202D和MON-202D后可以平角操作。油压式显微操作器当然首屈一指。注射器:IM 9B、IM 9C、IM-11、IM300。
防震:在很大程度上取决于注射室位于地下室还是高层建筑的十层(不管需要与否)。采用被动(铁板、沉重石桌、网球等)和主动设置。
参考文献
One-Step Generation of Mice Carrying Mutations in Multiple Genes by CRISPR/Cas-Mediated Genome Engineering
Haoyi Wang, Hui Yang, Chikdu S. Shivalila, Meelad M. Dawlaty, Albert W. Cheng, Feng Zhang, Rudolf Jaenisch, Cell 153, 910-918, May 9, 2013
-Multiplexed activation of endogenous genes by CRISPR-on, an RNA-guided transcriptional activator system
Albert W Cheng, Haoyi Wang, Hui Yang, Linyu Shi, Yarden Katz, Thorold W Theunissen, Sudharshan Rangarajan, Chikdu S Shivalila, Daniel B Dadon and Rudolf Jaenisch, Cell Research (2013) 23:1163–1171. doi:10.1038/cr.2013.122; published online 27 Aug 2013
神经元中基因编辑的插图。图片来源:杰克逊实验室哪怕在五年前,人们也会认为在活体大脑中进行DNA修复是科幻小说中才有的情节。但现在,科学家已能进入大脑、修复突变,并让细胞在整个生命周期中维持住这种修复效......
美国得克萨斯大学西南医学中心研发的新型基因编辑递送系统,在α-1抗胰蛋白酶缺乏症(AATD)临床前模型上实现了肝脏与肺部的同步靶向治疗。单次给药后,模型症状改善效果可持续数月。这项发表于最新一期《自然......
新一期《自然·通讯》杂志发表一项基因组学重大突破:美国耶鲁大学团队成功将在同一细胞中编辑多个DNA位点的能力提升了2倍,并有效减少了对附近基因位点的非预期突变。新成果使基因编辑的范围和精度同时得以扩大......
记者16日从中国科学院动物研究所获悉,来自该所、首都医科大学宣武医院等单位的科研人员,成功构建出一种新型工程化人类抗衰型间充质祖细胞(SRC),这种细胞能抵抗衰老、应对各种压力和避免癌变。他们还在猴子......
14日,亚洲首例接受多基因编辑猪肾移植的终末期肾病患者术后已超100天,成为全球仅有的2例猪肾移植存活病例之一,刷新亚洲纪录。据悉,这次异种器官移植手术用的猪肾脏,来自中科奥格生物科技有限公司四川省内......
近日,南方医科大学基础医学院教授荣知立团队通过空间结构优化和AI结构预测,显著提升了小型CRISPR-Cas12f系统的基因编辑效率,为精准高效的基因治疗提供了新的技术手段。相关成果发表于《自然-通讯......
为实现《欧洲绿色协议》中到2030年有机农业占比达到25%的目标,来自德国、荷兰、美国等国的科学家在近日发表于《细胞报告-可持续性》的一项观点文章中主张,欧洲应允许在有机及传统食品生产中使用无需上市前......
近日,中国水稻研究所水稻生物育种全国重点实验室研究员王克剑团队与中国科学院院士钱前团队合作研究,鉴定了一个新的水稻单倍体诱导基因OsPLDα2,并利用该基因成功创建了仅依赖基因编辑的正常结实率杂交水稻......
近日,广州大学教授关跃峰团队同合作者在国家重点研发计划、国家自然科学基金等项目的资助下,通过AI引导的蛋白质设计与基因编辑结合,创制了自然界不存在的GmSWEET10b优异基因型,提高糖转运能力,从而......
一种被称为先导编辑的前沿基因编辑技术首次用于治疗人类,标志着CRISPR家族功能最全面的“成员”首次在医学领域亮相。接受治疗者是一名患有罕见免疫疾病的18岁青少年。研究人员设计了这种治疗方法,以纠正导......