分解者：曲霉菌是自然界中的主要分解者之一。它们能够分泌多种酶，分解复杂的有机物如纤维素、木质素等，将有机物质转化为简单的无机物，从而参与营养物质的循环和能量流动。这一过程对于维持生态系统的物质平衡和生物多样性至关重要。
促进植物生长：部分曲霉菌种类与植物根系形成共生关系，帮助植物吸收水分和矿物质，同时提供某些生长调节物质，促进植物生长。这种互惠互利的关系对于植物的健康生长非常重要。
生物控制：曲霉菌通过产生抗生素和有毒代谢产物，能够抑制或杀死某些病原微生物和害虫，从而在一定程度上起到生物控制的作用。这有助于维护生态系统中的生物多样性和稳定性。
土壤肥力的改善：曲霉菌在土壤中的活动有助于提高土壤的通气性和保水性，同时通过分解作用释放营养物质，提高土壤肥力，为植物提供更多的养分。
环境监测指示物：由于曲霉菌对环境条件变化敏感，它们的存在和种类组成可以作为环境质量的指示器。例如，某些曲霉菌种类的出现可能表明环境污染或生态平衡的破坏。
物质循环推动者：曲霉菌参与了多个生物地球化学循环过程，如碳循环、氮循环等，通过其生命活动推动这些循环过程的进行，对地球生态系统的功能发挥起着关键作用。