核质相互作用（nucleocytoplasmic interaction）是指一个细胞内的细胞核与细胞质间的相互作用。
一般认为，细胞的各种性状，即形态、代谢活性、生理活动等的表现和方式等，是由核内的基因通过对包括酶在内的各种蛋白质的合成来控制的。但核的活性同时要受到作为其环境的细胞质的很大影响。
通过用原生动物、卵、粘菌类、藻类等将一个细胞分隔为一半有核和一半无核的实验，用原生动物、多细胞动物卵进行的核移植实验，以及由细胞融合所做的杂种细胞的实验，已充分了解到不仅核对细胞质有影响，而且细胞质对核的生理活动及形态也有显著的影响。