MEN-ⅡB综合征突出的症状是大多数(非全部)有粘膜神经瘤.神经瘤外表像发光小肿瘤,分布在唇,舌和口腔粘膜上.眼睑,巩膜和角膜亦常累及.厚眼睑和弥漫性增厚口唇是特征.与胃肠道运动异常的症状(便秘,腹泻和偶见巨结肠)常见,这是由于弥漫性肠道神经节瘤所致.虽然神经瘤面部特征和胃肠道病变早期就存在,但诊断综合征常常在晚年甲状腺髓样癌或嗜铬细胞瘤出现以后.除了马方样体态,脊椎骨骼异常(前突,后突,侧突),弓形足,足马蹄内翻常见.
约一半报告的病例示完全综合征,有神经粘膜瘤,嗜铬细胞瘤和甲状腺髓样癌.＜10%病人有神经瘤和嗜铬细胞瘤,而其余有神经瘤和甲状腺髓样癌无嗜铬细胞瘤.
甲状腺髓样癌和嗜铬细胞瘤很像MEN-ⅡA综合征中的相应疾病,两者倾向双侧和多中心.然而,甲状腺髓样癌在MEN-ⅡB综合征中特别倾向侵犯性,可见于很年幼儿童.