(一)不孕：子宫内膜异位患者常伴有不孕。根据资料报道，子宫内膜移位引起的原发性不孕占41.5～43.3%，继发性不孕占46.6～47.3%。盆腔内膜异位症常可引起输卵管周围粘连影响卵母细胞捡拾或导致管腔堵塞;或因卵巢病变影响排卵的正常进行而造成不孕。
(二)月经过多：内在性子宫内膜异位症，月经量往往增多，经期延长。可能由于内膜增多所致，但多伴有卵巢功能失调。
(三)痛经：为一常见而突出的症状，多为继发性，即自发生内膜异位开始，患者诉说以往月经来潮时并无疼痛，而从某一个时期开始出现痛经。可发生在月经前，月经时及月经后。有的痛经较重难忍，需要卧床休息或用药物止痛。疼痛常随着月经周期而加重。
(四)性交疼痛：发生于子宫直肠窝、阴道直肠隔的子宫内膜异位症，使周围组织肿胀而影响性生活，月经前期性感不快加重。
(五)大便坠胀：一般发生在月经前期或月经后，患者感到粪便通过直肠时疼痛难忍，而其他时间并无此感觉。子宫内膜异位病变围绕直肠形成狭窄者有里急后重及梗阻症状，故与癌瘤相似。
(六)膀胱症状：多见于子宫内膜异位至膀胱者，有周期性尿频、尿痛症状;侵犯膀胱粘膜时，则可发生周期性血尿。