1.氯普噻吨能加强中枢神经抑制药的药效，合用时应将中枢神经抑制药的用量减少到常用量的1/4～1/2。
2.与卡法根合用时，对多巴胺的拮抗作用增强，导致氯普噻吨的治疗作用和（或）不良反应均增加。
3.与阿替洛尔或美托洛尔合用时，可相互抑制对方的代谢，导致两者的作用增强，出现低血压反应及氯普噻吨的中毒效应。
4.三环类或单胺氧化化酶抑制剂与氯普噻吨合用时，镇静和抗胆碱作用增强。
5.与抗胆碱药合用时抗胆碱作用增强。
6.与锂剂合用（尤其是氯普噻吨的用量较大时），可能导致虚弱、运动障碍、锥体外系反应加重、脑病及脑损伤等。
7.与曲马朵、佐替平合用时，发生惊厥的危险性增加。
8.普拉睾酮可降低氯普噻吨的药效。
9.与抗胃酸药或泻药合用时，氯普噻吨的吸收减少。
10.与胍乙啶合用，胍乙啶的降压作用降低。
11.氯普噻吨通过阻断脑内多巴胺受体而影响左旋多巴活性，导致左旋多巴的抗帕金森作用降低。
12.与肾上腺素合用时，由于α受体活动受阻，β受体活动占优势，可导致血压下降。
13.与卡麦角林合用时，药理作用相互拮抗，导致两者的疗效均降低。
14.长效巴比妥酸盐，尤其是苯巴比妥可加快氯普噻吨的代谢速度，使氯普噻吨的作用降低。另外合用时可降低癫痫的发作阈值。
15.氯普噻吨可降低惊厥阈值，使抗惊厥药作用降低。
16.氯普噻吨可掩盖某些抗生素的耳毒性。
17.与酒精合用，能引起过度镇静。