一次静脉给药4毫克，在5分钟内给药，达到的血浆峰浓度约为65纳克/毫升。4毫克肌肉注射给药后，在注射后10分钟内达血浆峰浓度（约为25纳克/毫升）。肌肉注射4毫克和静脉注射4毫克后，其系统暴露是等同的。
昂丹司琼口服、肌肉注射或静脉注射后半衰期无明显差异，半衰期约为3小时，稳态分布容积约为140升。
昂丹司琼的蛋白结合率为71-76%。昂丹司琼通过不同的代谢途径，主要为肝脏代谢后从循环中清除。从尿中排出的原形药量小于摄入剂量的5%。缺乏酶CYP2D6（异喹胍多态性）不影响昂丹司琼的药代动力学。重复给药其药代动力学也无改变。
对健康老年志愿者的研究显示，口服昂丹司琼的生物利用度（65%）和半衰期（5小时）稍呈年龄相关的增加，但无临床意义。
可观察到昂丹司琼的利用度具有性别差异，女性口服后的吸收速率和程度较高，全身清除和容积分布较低（经体重调整）。
在一项试验中，月龄1-4个月的儿童（n=19）接受外科手术后，经体重标准化的药物清除率，比在5-24个月的儿童(n=22)慢月30%，但是与3-12岁的儿童相似。药物半衰期，在月龄1-4个月的儿童中平均为6.7小时，在5-24个月的儿童和3-12岁的儿童中为2.9小时。对于月龄在1-4个月的儿童的药代动力学参数出现的差异性，可能是因为在婴儿中水分占总体中的百分比更高，所以水溶性药物，如昂丹司琼，的分布容积更大。
进行性择期外科手术和全身麻醉的3-12岁儿童患者，其清除和分布容积的绝对值较成年人是下降的。两组数据随体重增加而呈线性增加，其数值12岁接近年轻成年人水平。当用体重将消除率和分布容积标准化后，其数值在不同年龄群是相似的。按体重给对428例受试者（包括癌症患者、手术患者以及健康志愿者）进行了群体药代动力学分析。受试者年龄为1个月到44岁，接受静脉注射昂丹司琼。分析结果显示，除了月龄为1-4个月的婴儿外，儿童和青少年口服或注射昂丹司琼的药物系统暴露量（AUC）与成人相当。本品的药物分布容积呈年龄相关性，成人的药物分布容积比婴儿和儿童低。除了月龄为1-4个月的婴儿外
本品的清除率与体重而非年龄呈相关性。由于进入1-4个月年龄组的受试者数量太少，不能肯定本品的清除率在婴儿中是否与年龄呈相关性降低，或仅是研究本身固有的变异。由于6个月以下的儿童进行手术后恶心呕吐的预防和治疗时只是单剂量给药，清除率的降低不具有临床相关性。
中度肾功能受损的患者(肌酐清除率15-60ml/min),其系统清除率及分布容积降低。可造成消除半衰期（T 5.4小时）稍有增加，但无临床意义。
对需定期血液透析的重症肾损害病人的研究显示，在血液透析间期测定的昂丹司琼的药代动力学基本无改变。在严重肝损害患者，昂丹司琼全身清除率明显降低，消除半衰期延长至15-32小时。