所有DNA功能都取决于其与特定蛋白质的相互作用。这些相互作用可以是非特异性的，也可以是极其特异性的。还有许多可以结合DNA的酶，其中，在DNA转录和复制中复制DNA序列的聚合酶特别重要。
DNA与组织蛋白（图1中白色部分）的交互作用，这种蛋白质中
的碱性氨基酸（左下蓝色），可与DNA上的酸性磷酸基团结合（右下红色）。
