细胞色素P450ⅡB6代谢的药物：体外试验表明安非他酮主要是由细胞色素P450ⅡB6同功酶所代谢，因此与其他影响细胞色素P450ⅡB6同功酶药物存在潜在的交互作用。
安非他酮可以被广泛代谢，因此合用其他药物将影响其临床疗效。如有些药物可以促进安非他酮的代谢（如卡马西平、镇静安眠剂、苯妥英），有些药物可以抑制安非他酮的代谢（如西米替丁）。24个健康志愿者参与的临床试验证明伴用西米替丁可以影响安非他酮及其活性代谢物的药代动力学。口服300mg本品后，是否合用800mg的西米替丁对原形和氢化代谢产物的药代动力学没有影响，然而苏氨酸氢化安非他酮和赤藓糖氢化安非他酮的AUC和Cmax分别增长了16%和32%。
细胞色素P450ⅡD6代谢的药物：许多药物（包括抗抑郁药、β-阻滞剂，抗心律失常药和抗精神失常药物）可被CYPⅡD6所代谢。体外试验表明安非他酮和羟安非他酮是此酶的抑制剂。一项研究有15个男性受试者参与，这些受试者均为CYPⅡD6酶的广泛代谢者，结果显示，每天服用安非他酮150mg，共两次后，再服用地昔帕明50mg一次，会使地昔帕明的Cmax、AUC、半衰期分别增加大约2、5、2.5倍。因此安非他酮与其他由CYPⅡD6酶代谢的药物合用时应当慎重。这些药物包括某些抗抑郁药（如：去甲替林、米帕明、地昔帕明、帕罗西汀、氟西汀、舍曲林），抗精神病药（如：氟哌啶醇、利培酮、甲硫达嗪），β-阻断剂（如：美托洛尔），Ⅰc类抗心律失常药物（如：普罗帕酮、哌氟酰胺），同时在合并治疗开始时应当使用最小剂量。正在使用CYPⅡD6酶代谢药物治疗的患者服用安非他酮时，应当考虑减少原来药物的剂量，特别是那些治疗指数窄的药物。
MAO抑制剂：动物研究显示单胺氧化酶抑制剂（MAOI)苯乙肼可以增加安非他酮的急性毒性。
左旋多巴：临床资料表明同时使用安非他酮和左旋多巴后，不良反应发生率可能升高。服用左旋多巴的患者同时服用本品时应谨慎，从最小剂量开始使用，然后逐渐加量。
降低癫痫发作阈值的药物：本品与降低癫痫发作阈值的药物（如：抗精神病药物，抗抑郁药物，茶碱，全身应用类固醇等）或者疗法（比如突然中断苯并二氮卓类药物）合用时应极其小心。
尼古丁透皮贴剂：临床研究提示安非他酮缓释片和尼古丁透皮贴剂合用具有较高的紧急治疗性高血压发生率，对此二者的联合应用应严密监测血压情况。