发布时间:2020-08-11 09:55 原文链接: 模板DNA的准备、实验的组织和PCR扩增实验

试剂、试剂盒 PCR 缓冲液ddH20基因组 DNAdNTP寡核苷酸引物

仪器、耗材 离心机和转子丙烯酸防护板过滤阻挡吸头多道移液器PCR 仪托盘 固定器装置底座管盖小管

实验步骤

一、材料


1. 缓冲液、溶液和试剂


含 15 mmol/LMgCl2 的 10XPCR 缓冲液 (GeneAmpPCR 缓冲液 I,AppliedBiosystems)


灭过菌的 ddH20


2. 酶和酶缓冲液


TaqDNA 聚合酶,(AppliedBiosystems 或 Invitrogen)


3. 核酸和寡核苷酸


基因组 DNA


10 mmol/L dNTP(GeneAmpPCRdNTP 混合物,AppliedBiosystems)


寡核苷酸引物(Invitrogen 公司合成,稀释成 lOumol/L)


4. 离心机和转子


用翻转吊桶式转子和微板适配器离心


5. 专用设备


丙烯酸防护板(acrylicshield)


过滤阻挡吸头(filterbarriertips)


多道移液器(Eppendorf 或 ApogentDiscoveries)


PCR 仪,96 孔(AppliedBiosystemsGeneAmp9700)


托盘/固定器装置和底座,96 孔(AppliedBiosystems)


管盖,一条 8 个(USAScientific 或 AppliedBiosystems)


小管,0.2 ml,一条 8 个(USAScientific 或 AppliedBiosystems)


二、方法


1. 在冰上融化 dNTP、10XPCR 缓冲液和未标记的引物。Taq 酶在加入反应混合物之前应保存在-20°C。在丙烯酸防护板后融化标记的引物。


2. 每一个反应的混合物包括:


灭菌 ddH20                                       6.95ul


含 MgCl2 的 10XPCR 缓冲液            1.25ul


10mmol/LdNTP                                  0.25ul


10mmol/L 未标记引物                        0.5ul


标记引物                                            0.5ul


在优化实验条件过程中,如果 PCR 产物的放射信号强度太低,可以增加标记引物的用量,同时按相应


比例调整 ddH20 的体积。


TaqDNA 聚合酶(终浓度为 0.25U)     0.05ul


对于一个 96 孔微孔板,准备用于 100 个反应的混合物。


3. 混匀,按等份加入放置在冰上的 PCR 板中(9.5ul/样品)。


4. 用多道移液器加入 3ulDNA(60ng),混匀。


5. 把盖子盖紧,将板放入预热到 94°C 的 PCR 仪中。


6. 如果产物大小是 200bp, 扩增 30 个循环。循环参数如下:94°C 初始变性 5 min;30个循环的 94°C 变性 30s; 根据经验确定的退火温度(Tm) 退火 30s;72°C 延伸 30s。最后一步 72°C 延伸 7 min。值可以通过引物序列计算出来,公式为 2(A+T)+4(G+C)。


7. 扩增完成后,将样品于-20°C 冻存,或者直接进入方案 3。