1、中毒型菌痢的抗菌治疗： 首选黄连素联合诺氟沙星，或氧氟沙星，或环丙沙星。口服，疗程3～5d。
(1) 黄连素：成人每次0.5g，2/d。小儿30mg/(kg·d)。
(2) 诺氟沙星：成人每次0.4g，2/d。小儿15～20mg/(kg·d)。
(3) 氧氟沙星：成人每次0.3g，2/d。小儿10～20mg/(kg·d)。
(4) 环丙沙星：成人每次0.4g，2/d。小儿10～20mg/(kg·d)。
(5) 重症及6月龄以下婴儿可选用下列药物：①头孢氨噻肟，成人每次1g，1/12h，肌注；儿童50～100mg/(kg·d)。②头孢去甲噻肟及头孢曲松，剂量同①。③对青霉素过敏者，可选用阿米卡星，成人每次80mg，1/12h，肌注。小儿2～5mg/(kg·d)。妥布霉素，成人每次80mg(8万U)，每8～12h一次，小儿4mg/(kg·d)，分2次肌注或静滴。
(6) 其他：尚可选用磷霉素、口服庆大霉素、SMZ-TMP等。
2、山莨菪碱 预防剂量为0.5～lmg/kg，一次静注。治疗剂量为成人40～60mg/次，小儿每次l～5mg/kg，3～15min 1次，静注。待面色好转、四肢暖、呼吸循环衰竭纠正即可停药。及时和短程足量是治疗成功与否的关键。药量必需高度个体化。
3、中毒型菌痢的液体疗法：
(1) 控制液体量：对于脑型、肺型，控制液体入量为生理需要量之80%，使患者处于轻度脱水状态。
(2) 扩容：对于休克型毒痢，足量扩容为抢救的关键措施。原则是先晶体液后胶体液，晶胶比例为3∶1。常用晶体液为醋酸钠平衡盐，或2∶1液(2份生理盐水、1份1.4%碳酸氢钠)；胶体液为低分子右旋糖酐，低右之用量为成人每次500ml，小儿10～15ml/kg，快速静滴或静注。所需液体总量随病情轻重及个体全身脏器功能不同而有很大差异。通常初速5ml/min或更多，小儿减半，待血压升至正常及有尿后减速。初期快速扩容，所需液体总量少，效果好。成人患者不伴脱水之毒痢所需液体量大致为：第1h，2∶1液500～1000ml，低右500ml，总量1000～1500ml，最初12h为2000～2500ml，24h为2500～3500ml。小儿酌减。
(3) 脱水：静注甘露醇，用于脑型毒痢。
(4) 纠正酸中毒：采用等渗碳酸氢钠溶液纠酸。
(5) 纠正电解质及糖代谢紊乱：注意补钾。重症可出现高血糖，合并严重酸中毒与低血钾，应及时纠正之。
4、中毒型菌痢的亚冬眠疗法： 适用于脑型。
5、改善肺换气功能 对于肺型，采用呼吸道持续正压给氧(CPAP)，或呼气末正压给氧(PEEP)，或高频通气(HFOV)。积极纠正低氧血症。
6、激素 静滴地塞米松，或氢化可的松，或甲基强的松龙。
7、其他 积极降温。必要时用镇静剂、强心药。中药生脉散、参附汤有助于休克之恢复。出现DIC时，可考虑肝素治疗。