多系统萎缩症治疗无特效疗法，一般用支持及对症治疗。
1、直立性低血压的治疗
（1）物理疗法在各种措施中，应当首先使用物理疗法，因为这些疗法简单实用而常能控制症状，如在卧位时应使头和躯干比下肢高15°～20°，常穿紧身裤和弹力袜等。
（2）药物治疗目前尚无特效药物。应给患者补充氯化钠（2～4g/d），增加血浆容量，根据需要增加盐和水分的保持。
2、帕金森综合征的治疗
可给予多巴胺替代治疗、单胺氧化酶-B抑制剂或多巴胺受体激动剂，但大多数患者反应不佳，或疗效只能维持短时间。
3、对症治疗
控制感染；对发生夜间呼吸暂停等症状者，设法改善通气，严重患者可行气管切开手术。
4、其他
维生素E、三磷腺苷（ATP）、胞磷胆碱（胞二磷胆碱）、毒扁豆碱等可能可缓解症状。