目前尚缺乏特效治疗，应强调一般及支持疗法，可试用利巴韦林或干扰素。新生儿心肌炎的进展迅速，应给氧及保持安静，出现心力衰竭时及早采用快速洋地黄疗法。给予适当的抗菌药物以防止继发细菌感染。有惊厥及严重肌痛者给予镇静剂或普鲁卡因局部封闭，麻醉剂如吗啡、哌替啶等不宜轻易采用。
肾上腺皮质激素可考虑用于心肌炎伴心力衰竭、心源性休克、严重心律失常（如高度房室传导阻滞、病态窦房结综合征等）、心包炎患者，可望取得一定效果。鉴于此激素可抑制机体免疫功能，有利于病毒的复制，因此一般病例不宜采用。
