1、性联遗传型低磷酸盐佝偻症— 药物治疗的开始时间，对于疾病的预后很重要。愈早治疗其预后情况愈好，因此疾病的早期诊断相当重要。对于有家族史的病童，因及早检查血液及尿液中是否有不正常的磷离子浓度，并且进行骨骼的X光摄影确认。最理想的诊断时间是出生后1个月至6个月之间。
2、性联遗传型低磷酸盐佝偻症— 治疗一般从婴儿时期约2岁开始。开始治疗时必须从低剂量开始给予磷酸盐及Carcitriol，目的在于防止腹泻。然后逐渐地提高药物剂量，就是所谓高剂量期。典型的方法，当病童服用了一年的高剂量药物后，会将药物剂量调整为长时间持续服用的较低剂量的治疗模式。
3、性联遗传型低磷酸盐佝偻症— 需依年龄选择合适的药物剂型。当病童年龄较小时，以考虑使用液态磷酸盐药物喂食，年龄大些可以调整成粉状或锭剂药物服用。
4、性联遗传型低磷酸盐佝偻症— 以上的药物治疗有时会伴随一些副作用。服用高剂量磷酸盐易造成的肾石灰沉着病及次发性副甲状腺过高症。因此在高剂量期必须经常监控血中Ca2+、P3-及肌氨酸酐，同时每月要监测尿液中的Ca2+及肌氨酸酐。再过了高剂量期之后的长期服用期，则可以每3至4个月再检查一次血液及尿液的数据。
5、性联遗传型低磷酸盐佝偻症— 目前药物治疗是否应用于成年人身上有很大的争议。因为过了成长期的成人病患服用此药物，虽然可改善生理症状及组织结构，但效果不如儿童时期就进行治疗来得有意义。