沙眼衣原体肺部感染的治疗主要为红霉素或四环素（不用于孕妇和儿童），口服；新生儿和婴儿的用量为红霉素，或琥乙红霉素，亦可用磺胺异唑。成人可用红霉素或四环素，口服；亦可用阿莫西林、多西环素治疗，或用氧氟沙星。对轻症感染，阿奇霉素亦有效。
