1.初始治疗
（1）应尽快找到导致发生腹膜炎的病因，详细了解是否有排便习惯改变，有无腹膜炎或管道相关感染史等。
（2）一旦出现引流液混浊，应立即给予广谱强效抗生素治疗，对引流液混浊的患者，在腹透液中加入肝素，有助于防止纤维蛋白阻塞管路。经验性抗生素必须覆盖革兰阳性菌和革兰阴性菌。万古霉素或头孢菌素可能覆盖革兰阳性菌，三代头孢菌素或氨基糖苷用于革兰阴性菌。在腹膜炎治疗，腹腔应用抗生素优于静脉给药，间断和持续给药效果相同，间歇给药的换液留置时间必须在6小时以上。在腹膜透析早期，轻微腹膜炎如由表皮葡萄球菌引起，口服头孢菌素治疗有效，但不适用于严重的腹膜炎。持续腹腔灌洗通常用于感染性休克和腹膜透析引流液严重混浊的患者。
2.后续治疗
一旦得到培养结果和药敏，抗生素治疗应适当调整为窄谱。初次治疗48小时内，大多数患者会有很大的临床改善，抗生素使用疗程14~21天。应每天观察引流液是否变为清亮。如果48小时后没有改善，应做细胞计数检查和再次细菌培养。实验室可用抗生素清除技术处理引流液，尽量得到最佳培养结果。真菌性腹膜炎患者常需立即拔管，继续抗真菌治疗至少10天，建议1~2个月后可考虑重新置管。难治性腹膜炎患者也需尽快拔管，全身使用抗生素继续控制感染，必要时借助血液透析维持透析治疗，否则将导致腹膜功能衰竭和增加患者死亡风险。
复发性腹膜炎患者若腹水白细胞计数<100×106/L，可拔管并在原位重置新管，这可使许多患者避免转为血液透析。