法莫替丁的剂量因不同情况而异。以成人为例，口服的常规剂量为每次20mg，一日2次，早餐后、晚餐后或临睡前服用，疗程一般为4到6周。溃疡愈合后维持量减半，睡前服用。对于肾功能不全的患者，应调整剂量。
对于儿童，用法用量如下：
胃食管反流病：口服，一日0.6～0.8mg/kg（一日最大剂量40mg），每12小时一次或睡前一次，疗程4～8周。
消化性溃疡：口服，一日0.9mg/kg（一日最大剂量40mg），睡前一次服用，疗程2～4周。
静脉滴注：一次不能超过20mg，应将本品溶解于5%葡萄糖溶液250ml中，滴注时间不少于30分钟，每12小时一次。
在使用法莫替丁时，请注意：
肾衰竭或肝病患者、有药物过敏史的患者应慎用；
妊娠期妇女慎用，哺乳期妇女使用时应停止哺乳；
对小儿的安全性尚未确立；
应在排除肿瘤和食管、胃底静脉曲张后再给药。