流感似乎不是一种很严重的病,但每年会造成25-50万例死亡。预防这种疾病的最有效方法是接种疫苗。不过,尽管流感疫苗接种在整体上很成功,但许多人却未能诱发有效的抗体应答。近日,一项新研究表明,血液中的基因表达谱也许能够预测流感疫苗接种后的应答。
人类免疫学项目联盟(HIPC)和人类免疫学中心的研究人员最近利用基于芯片的基因表达谱分析和RNA测序来追踪一些个体在接种流感疫苗之前和之后的基因表达模式。他们在《Science Immunology》上发表了结果,强调有十几个基因和三个相互关联的基因模块与35岁以下个体的疫苗接种应答相一致。
有意思的是,对于60岁以上的老年人而言,一些相同基因(包括参与炎性免疫的基因)的表达增强却预示着接种疫苗后的抗体应答较差。“我们发现,年轻人和老年人之间的基因和模块水平的基线差异是负相关的,”文章的通讯作者、耶鲁大学的研究人员Steven Kleinstein如是说。
在这项研究中,研究人员首先收集了500多名个体在接种疫苗之前和之后的抗体滴度测定,重点关注35岁以下或60岁以上的个体。这些个体从2008-2009年开始,已经连续五年接种流感疫苗。
之后,他们利用表达芯片或RNA测序,对参与者的全血或外周血单核细胞进行分析,以评估接种后的转录模式。对于其中的275人,他们还在接种流感疫苗之后立即采集血液样本,开展转录组分析。
利用一种称为基因表达定量集分析(QuSAGE)的分析框架,研究人员搜索了疫苗接种前后有着不同表达模式的基因和基因集合。他们发现了35岁以下的年轻人与疫苗应答相关的血液基因表达特征,其中包括9个基因,在显示出强烈的疫苗应答的参与者中往往高表达,以及6个基因,在抗体活性明显的个体中往往有着微弱的基线表达。
不过,老年参与者的血液基因表达模式却很难与疫苗应答相关联。研究人员无法确定疫苗应答者中表达增强的基因。此外,一些在年轻的疫苗应答者中表达升高的基因,却与60岁以上参与者的疫苗应答较差相关。
“我们发现,年轻人和老年人的特征之间存在着负相关。尽管炎性基因的存在预示着年轻人的抗体应答更好,但老年人则截然相反,往往与较差的抗体应答相关,”作者解释说。
Kleinstein及其同事认为,这些结果有望在接种流感疫苗前预测抗体应答。除此之外,它还有望解释流感疫苗成功接种背后的生物学机制,以及这些机制如何随年龄而改变。
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