测序揭示鲨鱼肝脏再生相关miRNAs

大量的证据表明，microRNAs（miRNAs）丰富地存在于肝脏中，并对肝脏的发育，再生及疾病的发生发挥着重要作用。为了更好地促进肝脏疾病与海洋生物的研究，近日，浙江理工大学的吕正兵教授，领衔其团队，对条纹斑竹鲨肝脏的miRNA进行了深入研究，研究成果发表在7月刊的BioMed Research International上。

虽然条纹斑竹鲨的基因组测序尚未完成，但最近提出的叶吻银鲛（callorhinchus milii）基因组是一个软骨鱼类基因组理想模型。因此，研究人员使用叶吻银鲛基因组预测pre-miRNA的发夹结构。通过小RNA测序，共有91个已知的miRNA和166个假定候选的miRNAs首次在条纹斑竹鲨中得到鉴定（小RNA测序服务由联川生物完成）。通过目标预测和GO分析， 在91个已知的miRNA中，筛选出46个miRNAs，特别是细胞增殖和生长相关的miRNAs。

研究人员进一步通过RT-PCR分析条纹斑竹鲨的miRNAs簇以及miRNAs的表达。在正常和再生肝组织中筛选出差异表达的基因,通过鉴定得到十个序列。

本研究是关于软骨鱼miRNA的首次全面报道， 为条纹斑竹鲨现有的数据库添加了大量新的miRNA序列信息，并为进一步研究miRNAs在条纹斑竹鲨肝脏发育中的功能奠定了基础。不仅为鱼类也为其它物种的肝脏miRNA研究做出了贡献。

*Conger Lu, et al. (2013) Study of MicroRNAs Related to the Liver Regeneration of the Whitespotted Bamboo Shark, Chiloscyllium plagiosum. BioMed Research International . [article]