日前,由中科院海洋研究所宋林生研究员课题组承担的“河鲀杂交优势机制的转录组解析”研究取得重要进展,相关研究成果在PLoS ONE上发表。
科研人员依托基因资源研究平台,使用SOLiD 4第二代高通量测序仪,通过对红鳍东方鲀、菊黄东方鲀及其杂交后代“冀研一号”的全转录组测序分析,获得了总长超过12 Gbp的序列,覆盖44,305个转录本。同时,科研人员还对14,148个差异表达转录本进行比较分析,初步确定了超过两千个杂交优势候选基因,得到了 35条与杂交优势有关的KEGG通路,发现“冀研一号”的基因表达模式分别符合显性效应、超显性效应及累加效应,由此推测“冀研一号”的杂交优势是由多种效应共同存在所决定的,证明了杂交东方鲀中存在大量的新转录剪切形式,具有离子结合、核酸结合及激酶催化等多种功能,这些新发现的转录剪接体同样可能与杂交优势密切相关。
该项研究完全依托中科院海洋所自主构建的海洋生物基因资源平台和超算平台独立完成,获取的转录组信息,为从基因调控网络的角度理解杂交优势形成和调节机制提供了重要数据资源,也为杂交优势的应用提供了理论指导。
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