发布时间:2024-06-07 15:51 原文链接: 清华大学仪器共享平台Harmony数据分析工作站

仪器名称:Harmony数据分析工作站
仪器编号:A23000084
产地:英国
生产厂家:PerkinElmer
型号:Operetta CLS
出厂日期:20230928
购置日期:20230928


所属单位:医研院>生物医学测试中心>细胞生物学平台>细胞平台光镜机组
放置地点:医学科学楼C119
固定电话:010-62799145
固定手机:
固定email:
联系人:汪晶晶(010-62799145,18514213047,sapphireking@mail.tsinghua.edu.cn)
孙悦(010-62799145,13121649797,sunyue@mail.tsinghua.edu.cn)
分类标签:图像处理 高内涵分析 数据分析 Harmony
技术指标:
  1. 38个预制分析模块:如细胞计数或核计数、活/死细胞计数、质膜标志物定量、胞质向核转位、胞质向膜转位、Spot分析、有丝分裂指数、细胞周期分类、神经细胞分析、脂滴形成分析、亚细胞结构分割、表型分析、神经生长、在线质量控制、纹理分析、3D微组织分析、细胞轨迹追踪等;

  2. 纹理分析功能:Kernel,Region,Indensity,Unnormalized等;

  3. 机器自学习模块:用户教导软件识别不同的细胞类群或区域,创建自定义的分析算法,可自学习细胞大小、形态、亚细胞结构,组织形态结构,信号分布差等参数;

  4. Star分析功能:由软件对图像进行自主分析,无需任何人工干预,帮助使用者找到最合适的分析方法。形态学参数不低于200个;

  5. 预设分析方案数据形式:可针对每孔数据导出统计学数据,细胞实验可导出每一单细胞数据,以便获取细胞异质性信息;

  6. 参数优化功能:可以手动优化分割参数,也可以由软件自动给出最佳参数(Turning优化法);

  7. 支持多种数据类型的导出:除可分析并导出整孔数据,同样可以给出单视野,单细胞的各种参数。

知名用户:暂无
技术团队:

汪晶晶 工程师,多年从事光学显微成像工作。

技术专长:

1.激光共聚焦显微镜成像技术

2.组织全景扫描成像技术

3.荧光光镊技术

4.活细胞显微成像技术

孙悦 工程师,细胞生物平台光镜机组负责人,多年从事光学显微成像工作。

技术专长:

1. 激光共聚焦显微镜成像技术

2.组织全景扫描成像技术

3.受激发射损耗超高分辨显微成像技术

4.荧光寿命成像技术

功能特色:
  1. 丰富的3D可视化功能,提供最大光强重建视图,XYZ多层切正交视图,多种3D重建渲染视图,任意角度层切视图、多层细胞定位视图。

  2. 各种视图下的3D数据分析:通过智能视窗功能对感兴趣区域确认分析参数,通过已确认的分析参数进行批量图像分析。

  3. 可计算细胞体积、3D表面积、3D最大截面积、3D球形程度 、3D投影面积、3D球形内径、3D 球厚度及高度等参数。

  4. 可计算3D位置参数:软件可批量计算3D球彼此距离、找到最近距离的3D球以及3D球与孔边缘距离、细胞在球体内的XYZ坐标参数以及群组细胞的3D共定位比例等。

  5. 多种3D微组织分区分析方式:可计算3D囊肿部及空腔区体积、3D肝组织内部空泡及肝实质区、3D 球体中阳性细胞到某球体边缘或半球边缘距离等,可批量导出单细胞数据、球体数据及整孔数据。

  6. 3D细胞纹理功能:可提供不少于6种的3D纹理学指标计算方式,提取纹理学参数重建的3D图像,批量导出单细胞数据、球体数据及整孔数据。

样品要求:

无。


预约说明:

  1. 所有大型仪器均可通过点击“仪器设备”,查看仪器设备联系人信息,可通过电话及邮件联系。

  2. 预约需至少提前12小时,预约后如有特殊原因无法按时使用仪器,请提前18小时取消预约。若超过取消时限或未取消预约的,按预约机时收费。

  3. 仪器未经预约不得私自使用。预约时间的最小单位为半小时,不足半小时或超过十分钟以上(含十分钟)按半小时记。本人预约本人使用,不得借用他人账号预约使用仪器。若发现该情况将取消借出人账号及权限。

  4. 实验结束请通知平台工作人员实验结束,填写实验登记并上交样品登记表。清理自带的仪器设备。仪器使用记录需如实填写,若出现故障在故障排除后要进行登记。

  5. 未经过培训与考核的同学可以使用自己的账号预约工作时间的辅助测试(周一至周五8:30-17:00),备注请注明:姓名、课题组、手机号、实验内容。第一次做实验的同学请尽量提前联系工作人员讨论实验细节,电话:62799145。

项目名称计价单位费用类别价格备注
测试费元/小时自主上机机时费240.0


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