灯刷染色体的着丝粒通常位于交叉附近。着丝粒有二种形态：一种为颗粒状，大小形态与前后染色粒不易区分，如东方蝾螈；另一种在着丝粒的前后带有由相邻染色粒彼此融合而成的轴棒，例如冠螈。着丝粒和轴棒上均无侧环。灯刷染色体着丝粒指数与体细胞的大抵相同。侧环与转录
侧环是DNA活跃地转录的区域。它们的长度相差很大，两栖类中侧环平均长度为10～15微米，长的可达200～300微米，小的在光学显微镜下难以分辨。通常一个染色粒具一对侧环，但有些染色粒可有数个侧环。在侧环上从转录起始点到终点称为一个转录单位。用电镜铺展术观察到侧环DNA细丝的转录过程：直径约为12.5微米的一系列的RNA聚合酶附着在转录单位的DNA细丝上。转录产物核糖核蛋白（RNP）在起始处较短，以后逐步增长。所以转录单位的宽窄不同（宽端约2～3微米），使每一转录单位在形态上呈现极性。多数侧环上只有一个转录单位，有些侧环则具数个转录单位，这些单位的转录方向可以相同，也可以不同。由于转录产物(基质-RNP）的种类、数量和堆积状态的不同，在某些染色体轴的特定部位可以形成不同类型的侧环。这些侧环是灯刷染色体的重要界标。
各个侧环不是同步地产生的。某些侧环能出现在不同成熟程度的卵母细胞的灯刷染色体上，而另一些仅在年青的卵母细胞中伸展并显示活跃的转录活性，以后即失去转录活性并回缩到染色粒中。在较大的卵母细胞中出现较长的侧环，回缩也迟。激素处理也能影响侧环的伸展和回缩，并能诱生象侧环样的其他类型的结构，这些形态变化的意义尚不清楚。