发布时间:2016-03-14 13:28 原文链接: 牛津纳米孔测序将全面升级,回避IlluminaZL之战

  一直以来,牛津纳米孔公司对其核心产品的微通道都持有保密态度,然而自测序巨头Illumina公司对其进行ZL诉讼之后,牛津纳米孔透露了其最新设备的驱动因子——细菌孔隙,似乎有意回避Illumina的ZL之战。

  纳米孔测序被誉为是一个比传统测序更便携和实惠的技术,根据单核苷酸通过孔隙产生的电流变化来检测DNA的序列,2014年,牛津纳米孔推出了第一款商业化的纳米孔测序仪——MinION。虽然研究人员称赞该技术并为提高其准确性而不断努力,但对MinION的孔隙结构一无所知。

  2月23日,Illumina公司起诉牛津纳米孔公司使用细菌驱动孔隙——耻垢分枝杆菌孔蛋白A(Mycobacterium smegmatis porinA,MspA)侵犯了Illumina的ZL。对那些担心失去纳米产品或担心ZL之战会扼杀新平台发展的研究人员而言,本次诉讼是一个非常痛心的消息。巴尔地摩约翰霍普金斯大学的生物医学工程师 Winston Timp说,“相比宣布一场诉讼而言,我更希望Illumina发布一个新的测序平台”。

  当地时间3月8日,牛津纳米孔公司为客户组织的网络直播演讲可能使不少人卸下心中的担忧。在此次网络直播演讲中,牛津纳米孔公司首席技术官 Clive Brown宣布了公司设备的升级——R9。Brown表示,R9实际上是CsgG,是来源于大肠杆菌的蛋白膜,也存在于多种细菌中,在核苷酸通过孔隙时这种蛋白应该比更新前的版本R7有更好的识别力。初步结果表明R7系统的精确度在75%到90%之间,取决于DNA通过孔隙时如何被读取,而新系统(R9)精确度在85%-95%之间。然而,Brown并没有透露关于R7的身份,但他表示公司将在今年春天将所有客户的系统更新至R9,一款只包含R9的更强大的测序仪—— PromethION将于三月底发布。

  比利时弗兰德斯生物技术研究所分子生物学家Han Remaut引领的研究团队已于2014年发布了CsgG的结构,牛津纳米孔技术公司对该孔隙持有独家ZL,Brown说,“对我们而言,这就是前进的方向。”

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