发布时间:2016-10-21 11:31 原文链接: 王恩多院士两篇JBC文章解析tRNA新分子机制

  tRNA是细胞内主要的RNA之一,是蛋白质合成中的关键生物大分子。在所有胞内的RNA中,tRNA具有最多的修饰,这些修饰对于tRNA在细胞内发挥功能起着重要作用,缺失某些修饰将引起细胞的严重缺陷甚至导致人类疾病。

  近期来自中科院上海生科院的王恩多研究组通过质谱、定点突变和酶学动力学等生物化学手段鉴定出tRNA上参与人NSun6(hNSun6)识别的关键元件。这一研究成果公布在Journal of Biological Chemistry杂志上。

  通常tRNA氨基酸接受茎部分的核苷酸较少被修饰,第72位的5-甲基胞嘧啶(m5C)修饰是为数不多的几个修饰之一。该位点的m5C修饰仅存在于高等真核生物中且极为保守,提示这个修饰可能在高等真核生物中具有重要的功能。NSun家族成员是真核生物中最主要的RNA m5C甲基转移酶。目前,Nsun6已经被报道能够催化tRNA第72位的甲基化修饰,但其对tRNA识别的关键元件尚不清楚。

  在这篇文章中,研究人员通过质谱、定点突变和酶学动力学等生物化学手段鉴定出tRNA上参与人NSun6(hNSun6)识别的关键元件。研究发现hNSun6的识别依赖于tRNA的倒L型三级结构,以及位于tRNA接受茎和D茎的特定的碱基或碱基对。具体识别元件为:(1)全长且正确折叠的tRNA;(2)3’端的CCA末端以及催化位点C72;(3)接受茎上的U73;(4)接受茎第二和第三对碱基对;(5)D茎的11:24和12:23两对碱基对。研究结果表明hNSun6采用三级结构和某些tRNA分子上的特定的元件这一复杂网络识别RNA。其它细胞内的 RNA似乎都不能满足hNSun6 识别的所有需要的条件,因此可以认为hNSun6是专一于tRNA的甲基转移酶。

  此外,近期这一研究组也同样在JBC杂志上发文,鉴定了细菌来源的多种ThrRS在N1结构域的存在与N2结构域活性位点的分布上的多样性与复杂性。

  蛋白质合成中,氨基酰-tRNA合成酶(AARS)从源头上介导氨基酸与tRNA之间的精确匹配,生成正确的氨基酰-tRNA,为核糖体提供原料。一方面,AARS需要高效地催化氨基酰化反应以合成正确的氨基酰-tRNA,满足蛋白质合成;另一方面,AARS需要通过水解编校功能以确保氨基酸与tRNA的正确匹配。

相关文章

西湖大学施一公团队新进展:解析人类pretRNA剪接机制

从tRNA前体(pre-tRNA)中去除内含子在生命的三个王国中都是必不可少的。在人类中,这一过程是由tRNA剪接内切酶(TSEN)介导的,包括四个亚基:TSEN2、TSEN15、TSEN34和TSE......

第九届全国科普讲解大赛在穗举办

以“走进科技你我同行”为主题的第九届全国科普讲解大赛21日在广东科学中心落幕。来自全国各地76个代表队249名选手通过网络视频连线的方式,在“云端”决赛,展示科学与技术的魅力,通过网络为公众呈现了一场......

揭示线粒体tRNA选择性降解导致HUPRA综合征的分子机制

中国科学院分子细胞科学卓越创新中心(生物化学与细胞生物学研究所)研究员周小龙团队与上海儿童医学中心研究员王剑团队合作以SelectivedegradationoftRNASer(AGY)isthepr......

非编码RNA调控仿刺参肠道再生和皂苷合成研究获进展

非编码RNA中的miRNA和tRNA在基因表达调控中扮演重要角色,然而在棘皮动物中相关研究较缺乏。中国科学院海洋研究所研究员李富花课题组通过多组学数据整合分析,揭示了棘皮动物miRNA和tRNA基因的......

人线粒体tRNA牛磺酸修饰酶GTPBP3催化GTP水解

近期,中国科学院分子细胞科学卓越创新中心(生物化学与细胞生物学研究所)研究员周小龙课题组和研究员王恩多课题组合作,在NucleicAcidsResearch上,在线发表题为ThehumantRNAta......

PLoSBiol:阻断蛋白ATM/ATR对丝氨酸tRNA合成酶的影响

大多数生物都需要氧气来生长发育。即使是癌性肿瘤也是如此。这就是为什么肿瘤在缺氧的情况下,会很容易地长出新的血管,为生存创造新的生命线。在一项新的研究中,来自美国斯克里普斯研究所和中国南开大学的研究人员......

链霉菌亮氨酰tRNA合成酶识别两类亮氨酸tRNA的分子机理

国际学术期刊《核酸研究》(NucleicAcidsResearch)在线发表了中国科学院分子细胞科学卓越创新中心/生物化学与细胞生物学研究所王恩多研究组的最新研究成果:LeuRScanleucylat......

特殊的蛋白质会影响肌肉再生与生长

"在过去的5-10年里,科学家们开始意识到LRS和其他类似的蛋白质具有独立于蛋白质合成的功能,"Chen说道。"以前,我的实验室和其他实验室发现,LRS的功能之一就是调节......

研究揭示人线粒体丙氨酰tRNA合成酶识别tRNA独特机制

2月15日,国际学术期刊《核酸研究》(NucleicAcidsResearch)发表了中国科学院生物化学与细胞生物学研究所王恩多研究组最新研究成果“TheG3-U70-independenttRNAr......

华人学者提出新概念:利用tRNA测序解析肠道微生物组

来自芝加哥大学的研究人员开发了一种高通量RNA测序新方法,分析研究肠道微生物组的活性。与一般的RNA测序不同,这些新工具分析的是转移RNA——tRNA,也就是将DNA中编码的遗传信息转化为执行基本生物......