单细胞测序技术是一种在单细胞水平上对基因组、转录组、表观组等进行高通量测序分析的技术。单细胞测序技术能够在组学水平揭示细胞间的异质性。单细胞水平细胞谱系追踪技术位居2018年Science 杂志评选的十大科学突破之首。常规单细胞转录组测序技术丢失了细胞在原组织中至关重要的空间位置信息，而单细胞空间转录组技术在进行单细胞转录组测序的同时保留并记录了细胞的空间位置信息。空间转录组技术能够揭示细胞间的相互作用以及细胞所处的微环境，将成为发育生物学、神经生物学、免疫生物学、肿瘤微环境等领域的研究利器。
11月12日，《核酸研究》（Nucleic Acids Research）在线发表了中国科学院生物物理研究所高通量测序中心题目为SpatialDB: a database for spatially resolved transcriptomes 的论文，发布第一个单细胞空间转录组数据库及数据在线可视化平台。SpatialDB系统收录了来自5个物种由8种空间转录组技术产生的数据，建立了空间转录组数据分析处理流程，实现了空间转录组数据的在线可视化，同时提供了空间差异表达基因及其功能富集分析的注释。
中科院院士、生物物理所研究员陈润生以及高级工程师陈小伟为论文共同通讯作者。生物物理所高通量测序中心高级工程师范珍为论文第一作者。该研究获得中科院关键技术人才项目、国家自然科学基金和国家重点研发项目的资助。
生物物理所开发单细胞空间转录组数据分析可视化平台
BeaconDiscovery™单细胞功能表征平台将帮助研究者解锁活体单细胞功能分析的全部潜力。它采用Beacon®的光电定位（OEP）和微流体芯片光技术，使研究人员能够实时探索多模态和动态细胞反应，......
2025年4月26日，由北京市科学技术研究院分析测试研究所（北京市理化分析测试中心）、创新方法研究会科学工具专业委员会、北京理化测试技术有限公司主办，北京市科学技术研究院生物技术与健康研究所、宁波华仪......
喉气管狭窄(LTS)作为临床上棘手的上呼吸道疾病，其典型特征是细胞外基质(ECM)异常沉积导致的气道狭窄。随着COVID-19等公共卫生事件中气管插管应用的增加，医源性LTS的发生率显著上升。尽管手术......
由于无法对蛋白实现扩增，因此在单细胞多组学的研究中，单细胞蛋白质组学是最具挑战的研究，近年来已取得突飞猛进的进展。除了质谱仪检测灵敏度的提升，在前端取样、预处理和分离方面的巨大进步是重要因素，这和微流......
过去几年里，单细胞蛋白质组学技术取得了长足发展，单细胞蛋白质组学逐渐走向成熟，后续有望广泛应用于肿瘤异质性分析、免疫学研究、发育生物学、神经科学以及精准医学等领域。然而，从技术发展成熟到实际场景应用分......
中国科学院广州生物医药与健康研究院与北京大学生物医学前沿创新中心/昌平实验室合作，在国家自然科学基金、国家重点研发计划等项目的资助下，开发面向大规模异质性空间转录组学切片的表征与空间特征解析方法PAS......
近年来，单细胞RNA测序技术（scRNA-seq）在揭示复杂生物系统和探索遗传学及临床研究中取得了突破性进展。然而，仅依赖单一的转录组信息往往难以区分分子相似但功能差异显著的细胞类别。因此，融合多种模......
近日，中国农业科学院棉花研究所乡村振兴科技创新团队牵头构建了首个结合单细胞转录组、空间转录组及空间代谢组的棉花纤维起始发育图谱。利用该图谱可以识别关键基因的表达模式及其与代谢途径的关系，深入剖析纤维发......
1月12日，记者从宁波华仪宁创智能科技有限公司获悉，该公司研制的单细胞代谢物分析质谱仪近日入选浙江省经济和信息化厅、浙江省财政厅印发的《2024年度浙江省首台（套）装备名单》，档次为国际首台（套）。该......
近日，中科院大连化物所生物技术研究部生物分子高效分离与表征研究组（1810组）张丽华研究员和袁辉明研究员团队在单细胞分泌组分析新方法研究中取得新进展，通过结合非天然氨基酸代谢标记、基于点击化学的选择性......