EIS 可产生多价离子化的蛋白或多肽，允许相对分子质量达1×105 蛋白进行分析，分辨率在1500-2000amu。精确度在0.01%左右。EIS 更适合相对分子质量大的蛋白质的在线分析，且需要气化或有机溶剂使样品敏感化。利用EIS 与HPLC 联合分离分析GH 和血红蛋白均获成功，其也可与CEZ 联合应用。
