病菌感染的原因主要包括细菌、病毒、真菌、立克次体以及寄生虫等微生物的侵入。这些微生物可以通过不同的途径进入人体，例如：
细菌：细菌侵入人体后会释放毒素和刺激性物质，导致炎症反应。常见的细菌感染疾病有肺炎、白喉、百日咳等。
病毒：病毒进入体内后会利用宿主细胞复制自身，引起免疫应答，导致发热、乏力等症状。常见的病毒感染疾病有流感、艾滋病等。
真菌：真菌通过直接侵犯或产生毒素损伤组织，引发炎症和组织损坏。常见的真菌感染疾病有皮肤癣菌病、念珠菌病等。
立克次体：立克次体通过吞噬细胞扩散并繁殖，导致局部和全身炎症反应。常见的立克次体感染疾病有斑疹伤寒等。
寄生虫：寄生虫在体内生长繁殖可导致器官功能障碍和组织损伤。常见的寄生虫感染疾病有疟疾、血吸虫病等。